直腸滴灌是會有壹些疼痛，但不會太難受，能夠忍得過去。
直腸滴灌是屬於中醫的外治療法，也是屬於臨床上較為常用的方法，也是常用的給藥途徑。直腸滴灌主要是通過，滴管將藥物緩慢的滴入到直腸內，藥物通過直腸的粘膜進行吸收，最終達到治療的目的。
直腸滴灌療法減少胃以及小腸對藥物的影響，尤其是適用於不能夠進口給藥的患者，特別是壹些經口給藥小兒不配合的患者，會降低患兒的痛苦，降低藥物的無效流失，更有利於藥物發揮治療作用。在進行滴灌之前，需要排空肛管直腸內的糞便，同時可以使用溫水對肛門局部進行簡單清洗。
進行直腸滴註時，要註意藥液的灌註量和藥液滴入的速度，藥液的溫度不易過低。而且月經期女性、妊娠期女性不宜進行直腸灌入。