腦損傷:
包括孕期尷尬流產導致的大腦發育不全、早產、難產、分娩時新生兒腦損傷、嬰兒感染腦炎、腦膜炎等疾病導致的腦損傷，都可能增加自閉癥的幾率。
(2)孕期病毒感染:
女性在懷孕期間可能會感染麻疹或流感病毒，這可能會損害胎兒的大腦發育，並導致自閉癥。
(3)遺傳因素:
在20%的自閉癥患者中，他的家庭可以發現有智力障礙、語言發育遲緩和類似自閉癥的人。此外，約10%的自閉癥男孩存在染色體脆性。
(4)代謝性疾病:
先天性代謝障礙，如苯丙酮尿癥，引起腦細胞的功能障礙和紊亂，會影響大腦神經信息傳遞的功能，引起自閉癥。
(5)當然還有其他關於原因的討論，但沒有確切的原因。
自閉癥是對寒冷和危險的外部世界的逃避。行為主義者認為，自閉癥是父母對孩子行為不當強化的結果。