11月，臺灣省駐臺中警備司令劉英奉劉銘傳之命，征召擔任兵部博士的林朝東北上幫忙，於是林朝東帶領500名鄉兵和兩個月的口糧前往基隆，鎮守大烏倫堡，隨後清軍放棄防守，前往大水庫(今基隆市安樂區)協助前線作戰。1885 65438+10月9日，法軍在大牛鋪(今臺北縣公寮鄉吉林村桃園谷)探地形，與林朝東的軍隊發生沖突，最終被林朝東擊退。65438年10月25日，法軍以1900兵力進攻清軍溫暖防線。雙方爆發了第壹次每月壹次的梅山戰役，林朝東率眾支持。65438年10月30日，率部夜襲福建阜寧鎮督戰的曹治中。雙方浴血奮戰至次日淩晨，隨後法軍多次以小股兵力進攻，但均被林朝東擊退。3月4日，法軍派出1280兵力再次進攻溫防線，雙方爆發了第二次月度梅山大戰。這壹次，法軍切斷了清軍的戰線，壹舉攻占了嶽眉山山頂，用大炮轟擊林朝東等營。最後清軍大敗。只有林朝東帶領鄉勇穩住陣腳，成功協助清軍主力退守基隆河南岸。獲勝的法軍彈藥耗盡，3月7日的暴雨導致河水暴漲，所以沒有過河取暖。
之後兩軍繼續對峙，直到6月1885法軍撤退。12年5月，林朝東因助戰有功被獎勵為布道者。雖然立功不高，卻獲得了劉銘傳的青睞。因此，戰後臺灣鄉勇三十多個營被裁撤，而朝東、兩個營被保留並編入清軍，林本人在臺灣省建省後受到高度重視。