托馬斯·安德森表面上是壹家知名軟件公司的計算機工程師，但他同時也是壹名計算機黑客，化名“尼奧”。有壹天，壹個叫Trinity的女黑客自稱受著名黑客Morpheus的委托與他聯系，並向他透露Matrix在找他。第二天，尼奧被三名黑衣男子帶走，並被植入了監控裝置。
後來，墨菲斯遇見了他，問尼奧是否想知道關於母體的真相。尼奧同意吞下壹顆紅色藥丸(實際上是壹個跟蹤程序)後，突然在培養皿中醒來，發現自己身上連著許多管子。
簡介:
生活在《黑客帝國》中的年輕黑客Neo發現，看似正常的現實世界實際上似乎被某種力量所控制，於是Neo在網上調查了此事。
生活在現實中的人類抵抗組織隊長墨菲斯(勞倫斯·菲什伯恩飾)壹直在尋找《黑客帝國》中傳說中的救世主，於是在人類抵抗組織成員三壹(凱莉·安妮·莫斯飾)的指引下，兩人相遇。
在墨菲斯的指引下，尼奧回到了真實的現實，逃離了母體。直到那時，他才意識到他壹直生活在壹個虛擬的世界裏。