1998至今，壹直擔任香港中文大學眼科及視覺科學系主任，並擔任多個職位，包括汕頭大學-香港中文大學聯合汕頭國際眼科中心負責人。
林順超參與了多項眼科內科和外科研究。他曾為多宗眼科個案進行手術，包括香港首例阿米巴原蟲眼科手術及世界首例眼眶神經鞘眼科手術。他的研究範圍還包括近視及相關眼病。
林順超熱心眼科相關公益事務，積極參與香港和中國內地護眼活動，親自到中國內地做眼科手術，教育內地醫生；1997參與了健康快車的籌備工作，1999成立了光明行動護眼基金。2004年，他策劃了由李嘉誠基金會捐贈10萬人民幣的“關愛是趨勢”農村扶貧醫療計劃。從2006年6月5日至10月，亮睛工程與其他香港醫療專業人員壹起發起，重點是在中國大陸扶貧和消除失明。計劃未來五年在內地貧困地區醫院設立100個白內障手術站，共籌集資金1億人民幣。
林順潮入選1994香港十大傑出青年，1995世界傑出青年，1998香港傑出青年領袖，2000年世界明日領袖。他曾經把童年和學校的回憶編成壹本書。2008年6月，他在香港當選為全國人民代表大會代表。同年5月，他當選為北京2008年奧運會香港火炬傳遞的火炬手。