1，不壹樣的甜
木糖醇的相對甜度和蔗糖差不多，都是1.0。赤蘚糖醇的相對甜度在0.7左右，木糖醇的相對甜度更高。
2、降溫效果不同
木糖醇和赤蘚糖醇都有清涼感，但赤蘚糖醇的清涼效果比木糖醇好。這是因為赤蘚糖醇的溶解熱和吸收熱最高，赤蘚糖醇的溶解熱為-43千卡/克，木糖醇為-36.5千卡/克。
3.不同能量系數
在GB 28050-2011的問答中，規定赤蘚糖醇的能量系數為0 kJ/g，木糖醇的能量系數為10 kJ/g，實際上赤蘚糖醇的能量系數約為1.7kJ/g，木糖醇的能量系數為16.7kJ/g/g..
4.安全性和容忍度是不同的。
赤蘚糖醇的耐受量大約是木糖醇的兩倍，男性對赤蘚糖醇的耐受量大約是0.68？G/kg體重，女性的耐受量在0.8左右？克/千克體重；木糖醇對男性的耐受量大概是0.3？G/kg體重，女性大約0.3-0.5？克/千克體重。
木糖醇過量食用會產生腹脹、腸鳴、腹瀉等副作用，而赤蘚糖醇耐受性較高，不易產生產氣或輕度腹瀉等副作用。
5.不同吸濕性
木糖醇的吸濕性高於赤蘚糖醇:赤蘚糖醇在90%的空氣濕度下不會吸濕；當相對濕度為86%(23℃，2d)時，木糖醇的吸水量約為7.64%。
6.身體的吸收和代謝是不壹樣的。
赤蘚糖醇進入體內後不能被任何酶系統消化降解，只能通過腎臟從血液中過濾出來，通過尿液排出體外。另有10%進入大腸，幾乎不能被細菌發酵利用。
木糖醇的80%被肝臟代謝，50%以上轉化為葡萄糖，約45%被氧化，其他少數部分變成乳酸。
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