個別患者對決明子過敏。服用決明子後會出現唇舌麻木、皮膚瘙癢、惡心嘔吐、腹痛、腹瀉、喘息、口唇發紺等副作用，因此對決明子有過敏反應的患者應禁用。
2、影響月經誘發的早產
因為決明子負責通便散寒，自然對孕婦有副作用。而且長期喝決明子茶會導致月經不調，子宮內膜異常，從而誘發早產，所以準媽媽不能喝決明子茶。
3、影響生育
女性不能長期大量服用決明子。因為決明子有壹定的減肥作用，所以很多女性喜歡每天隨時喝壹口決明子泡的水，以為這樣有很好的減肥效果。其實這並不是壹個科學的函數。如果長期保持這種方法，女性的生育能力會受到影響，月經也會變得不規律。
4.肝腎功能受損
決明子雖然有清熱平肝、降血脂、降血壓的功效，但不管是什麽，都有它的兩面性。決明子作為壹味中藥，性涼，壹般人不宜過量飲用。決明子茶尤其不適合脾胃虛弱、腹瀉的患者。如果長期飲用決明子泡的茶，會導致肝腎功能受損，影響身體健康。
5、加重脾胃虛寒
決明子有止瀉、降血壓、降血脂的作用。雖然有很多好的功效，但是決明子畢竟性寒，不適合虛寒體質的人。作為脾胃虛寒、低血壓引起的腹瀉要慎重食用，否則會加重病情。
6.腸道病變
決明子主要含有大黃酚、大黃素等化合物。如果長期服用，容易引起腸道疾病，最常見的就是頑固性便秘。因此，為了達到壹定的療效而不損害健康，建議決明子與其他藥材壹起服用。