鍋內放入熱水，雞蛋的蛋清會迅速凝固，包裹住蛋黃，這樣煮出來的荷包蛋形狀完整，不易散開。水開後不要馬上把雞蛋打入水中。先關小火，等水面平靜後再敲雞蛋，這樣蛋清就不容易浮在水裏了。雞蛋打入水中後，需要小火煮5分鐘左右；不要大火，防止蛋液溢出擴散。
煮荷包蛋要選擇新鮮的雞蛋。如果雞蛋在耳邊輕輕晃動，能聽到流動的聲音，說明雞蛋不夠新鮮，煮熟後容易散開，不易成型。水煮荷包蛋也可以先在勺子裏抹上壹層薄薄的油，然後將雞蛋打入勺子裏，再將勺子放入開水中，待蛋白凝固後再將雞蛋放入水中，這樣水煮荷包蛋的外觀更加完整美觀。
挑選雞蛋的小技巧:
1.觀察外觀:新鮮雞蛋表面應光滑，無裂紋、汙跡或沙眼。蛋殼顏色均勻，沒有斑點或淺色區域。
2.搖雞蛋:輕輕地搖雞蛋。如果聽不到聲音或者聲音很小，說明雞蛋比較新鮮。如果聽到明顯的響聲，可能是因為蛋黃和蛋白質已經分離，這樣的雞蛋不新鮮。
3.看光:對著光源(如陽光或燈光)觀察雞蛋。新鮮的雞蛋應該是紅色的，半透明的，蛋黃輪廓清晰。如果雞蛋顏色較深、不透明或有色斑，說明雞蛋已經老化或變質。
4.檢驗日期:購買雞蛋時，可以查看包裝上的印刷日期，選擇更接近生產日期的雞蛋，這樣雞蛋相對更新鮮。
5.水中試驗:將雞蛋放入清水中。如果雞蛋平躺在水底，說明雞蛋很新鮮。如果雞蛋斜放在水裏，至少存放了3~5天。如果雞蛋直立在水中，它可能會儲存10天。如果雞蛋浮在水面上，它可能已經壞了。