1.壹般治療
幼兒直腸脫垂有自愈的可能，應註意縮短排便時間，便後立即將脫出直腸復位，取俯臥位，用膠布固定雙臀等。成人也應積極治療便秘、咳嗽等引起腹壓增高的疾病，以避免加重脫垂程度和手術治療後復發。
2.藥物治療
將硬化劑註射到脫垂部位的黏膜下層內，使黏膜與肌層產生無菌性炎癥，粘連固定。常用硬化劑為5%石炭酸植物油、5%鹽酸奎寧尿素水溶液。對兒童與老人療效尚好，成年人容易復發。
3.手術治療
成人完全性直腸脫垂的手術方法很多，各有優缺點和不同的復發率。手術途徑有4種：經腹部、經會陰、經腹會陰和經骶部。前兩種途徑應用較多。
直腸懸吊固定術治療直腸脫垂療效肯定。術中遊離直腸後，可通過多種方法將直腸、乙狀結腸固定在周圍組織上，主要為骶前兩側的組織上，註意勿損傷周圍神經及骶前靜脈叢；可同時縫合松弛的盆底筋膜、肛提肌，切除冗長的乙狀結腸、直腸。
經會陰手術操作安全，但復發率較高。可將脫出的直腸甚至乙狀結腸自肛門直接切除縫合。直腸黏膜脫垂可采用痔環行切除術方法切除脫垂黏膜。年老、體質虛弱者可簡單地行肛門環縮術，即用金屬線或滌綸帶在皮下環繞肛門，2～3個月後取出皮下埋置物，使肛門縮緊以阻止直腸脫垂。