1.植物種
木瓜是木瓜科木瓜屬的壹種常綠木本植物。它也是著名的新鮮熱帶水果。其果實豐滿、細膩、芳香，而木瓜是被子植物枯葉灌木的成熟果實。這些水果都長在樹上，個頭很大，外形和木瓜很像。
在自然環境中生長
木瓜和木瓜生長在不同的自然環境中。雖然木瓜和木瓜都喜歡溫暖濕潤的自然環境，但木瓜會有壹定的抗寒能力。這種綠植在溫差很大的華北地區也能正常生長，但以安徽產的木瓜質量最好。而木瓜則必須生長在溫暖的地區，在我國北方地區很難見到這樣的綠色植物。廣東、廣西、雲南、福建等熱帶氣候是木瓜的主要產區。
3.營養元素
木瓜和木瓜的營養元素也有顯著差異。雖然都含有壹定量的大豆蛋白，但木瓜中的多糖、膳食纖維及其碳水化合物的含量遠遠高於木瓜。還富含木瓜蛋白酶胰蛋白酶。人們在進餐後，木瓜能吸收充足的營養，滋養血氣，調節內分泌，但木瓜的含量較低，人們服用後養生效果並不顯著。
4.功能和功效
木瓜和木瓜在功能和功效上也有明顯的區別。木瓜可以作為日常生活中每個人的新鮮水果。能使機體消化吸收大量的水分、糖分和各種營養物質及礦物質，提高身體素養，增強機體抗工作能力，防止衰老。木瓜在日常生活中主要用作藥物。能調理腸胃，疏通經絡，祛風除濕，是治療人們風濕關節痛、風濕的常備藥。