壹級保護動物如下:
蜂猴、熊猴、臺灣省猴、豚尾猴、葉猴、金絲猴、長臂猿、馬來熊、大熊貓、紫貂、貂熊、浣熊、東北虎、雲豹、豹、虎、雪豹、儒艮、白鰭豚、中華白海豚、亞洲象、蒙古野驢、西藏野驢、野馬、野駱駝。塔爾羊、卡普拉野山羊、海貍、短尾信天翁、白腹軍艦鳥、白鸛、黑鸛、朱鹮、秋沙鴨、金雕、白肩鷹、玉帶鷹、白尾鷹、虎頭鷹、禿鷲、松雞和斑尾榛。黑頸鶴、白頭葉猴、丹頂鶴、紅頸鶴、大鴇、海鷗、四爪陸龜、鱷蜥、巨蜥、蟒蛇、揚子鱷、新疆鱅魚、中華鱘、鱘魚、中華鱘、紅珊瑚、庫恩蠍子。
二級保護動物:
哺乳動物獼猴獼猴西藏酋長猴穿山甲豺黑熊棕熊(包括馬熊)小熊貓紫貂黃喉水貂水獺(所有物種)小爪水獺斑點森林浣熊貍貓草原斑點貓沙漠貓叢林貓猞猁兔的猴子金貓釣魚貓河鹿(包括白腰鹿)水鹿麋鹿黑斑羚藏原羚鵝喉羚羊巖羊海南兔山兔塔裏木兔巨松鼠鰭足類(所有物種)鯨類(除壹類外) 爬行動物三線鎖甲魚綠甲魚凹甲魚雲南鎖甲魚大壁虎山甲魚地甲魚太平洋海甲魚地甲魚地甲魚兩棲動物貴州疣螈、小痣疣螈、鎮海疣螈。 文昌魚、鳥類、紅頸鵜鶘(所有物種)、鰹鳥(所有物種)、海鸕鶿、巖鷺、海南虎斑笛鯛、小蘆葦笛鯛、彩鸛、白琵鷺、黑面琵鷺、紅胸黑雁和白天鵝(所有物種)、隼科(所有物種)灰鶴、蓑羽鶴、長腿秧雞、吉田雞、褐背蛙、花蛙、小鷗、黑浮鷗、黃嘴河燕鷗、黑腹沙雞、綠鳩(中 灰喉針尾雨燕、鳳頭雨燕和橙胸咬鵑小鷸、白枕鶴、榛雞、黃嘴白鷺、彩鷺、白鷓鴣、黑頸鸕鶿、八色鸕鶿科(所有物種)、黑耳翠鳥、布谷鳥鳩(所有物種)、黑嘴鳳頭燕鷗、銅翅雉雞、沙丘鶴、黑耳。