這種肽鏈被認為在阿爾茨海默病的發展中起主要作用。阿爾茨海默病患者大腦中形成的斑塊主要由β-澱粉樣肽組成。這種肽也可能在其他神經系統疾病的發展，如路易體癡呆。
作用β-澱粉樣斑塊主要由壹種長42個氨基酸的肽形成。這種肽較常見的形式只有40個氨基酸，但42AA肽更容易形成斑塊。斑塊的形成是因為蛋白質是纖維形成的，這意味著它有與其他類似蛋白質聚集在壹起形成纖維結構的趨勢，這些結構是逐漸抑制阿爾茨海默病患者正常大腦功能的斑塊澱粉樣蛋白是壹種纖維蛋白堆積，是阿爾茨海默病的生物學特征；研究表明，這些斑塊會導致癡呆，因為這些肽纖維團會附著在大腦中的神經元上。壹旦粘附，這些纖維阻止神經元接收來自大腦其他細胞的信號受影響的神經元不能正常工作或與其他腦細胞通訊，結果死亡。
研究表明，肽纖維團附著在大腦中的神經元上，導致癡呆阿爾茨海默病是部分遺傳的，這壹特征與產生長度為42個氨基酸的β-澱粉樣肽的傾向有關。當壹個人擁有壹個產生42AA肽的基因拷貝時，他或她患老年癡呆癥的風險增加。壹個人有兩個這種基因的拷貝，患早發性阿爾茨海默氏癥的風險很高。基於對蛋白質如何相互作用形成斑塊的認識，研究人員提出了幾種治療阿爾茨海默病的潛在療法，其中壹種是β-分泌酶抑制劑，這種酶可以阻止澱粉樣蛋白裂解成42AA形式，這種酶與阿爾茨海默病的發展密切相關老年癡呆癥。壹個相關的想法是伽瑪分泌酶，另壹種治療老年癡呆癥的方法是開發壹種β-澱粉樣抗體，這種抗體可以識別並結合42AA肽能夠與肽結合並防止它形成斑塊另外，抗體可以促進肽的破壞，由於免疫系統會破壞形成的抗體肽復合物。