首先，喝咖啡會影響睡眠質量。咖啡含有相當高的咖啡因，可達0.4g-1g/100g。咖啡因的作用現在已經很明確了，可以興奮神經。
這是因為咖啡因的化學結構與人腦中壹種引起大腦興奮的化學物質非常相似，可以使大腦處於興奮狀態，導致失眠。往往這樣會影響孩子的生長發育。
長期喝咖啡還會引發心血管疾病。如:心跳加速、高血壓等。如果青少年患有胃腸疾病，喝咖啡會加重病情，因為喝咖啡後胃酸增多，會刺激胃黏膜和潰瘍面。
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喝咖啡的禁忌:
記住咖啡不能和茶同時喝。茶和咖啡中的單寧酸能減少75%的鐵吸收；
茶和咖啡中的鞣酸會減少鈣的吸收。所以喝茶喝咖啡的時間最好選在兩餐之間；
含咖啡因的飲料和食物被孕婦大量飲用後會引起惡心、嘔吐、頭痛和心跳加快。咖啡因還會通過胎盤進入胎兒體內，影響胎兒發育；
許多醫生認為，孕婦每天喝1~2杯(每杯6~8盎司)的咖啡、茶或碳酸飲料不會對胎兒產生影響。但為了謹慎起見，孕婦最好禁用。咖啡因會導致流產率上升，所以要喝不含咖啡因的飲料；
兒童不應該喝咖啡。咖啡因會興奮兒童的中樞神經系統，幹擾兒童的記憶力，引起多動癥。
濃茶、咖啡、碳酸飲料也是消化道潰瘍形成的危險因素；因此，胃病患者不宜多喝咖啡；
咖啡飲料中含有咖啡因，容易引起耳鳴；
咖啡不宜與布洛芬同吃。布洛芬是常用的解熱鎮痛消炎藥，對胃黏膜有刺激作用，而咖啡、可樂中的壹些咖啡因也能刺激胃黏膜，促進胃酸分泌。如果服用布洛芬後立即飲用咖啡和可樂，會加重對胃黏膜的刺激。
喝完咖啡後不宜立即吸煙。咖啡中的壹些成分與香煙結合產生致癌物質。
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