陜西省隴縣秦嶺省級自然保護區建立以來，采取了壹系列有效措施，有效保護了以秦嶺大馬哈魚為主要對象的珍稀瀕危物種，改善了保護區的森林資源和其他生態系統。保護區背景調查、綜合科學考察報告、總體規劃等基礎工作已基本完成。保護區邊界清晰，土地權屬明確，核心區、緩沖區、實驗區劃分合理，符合國家級自然保護區條件。(在建項目)
2006年，經過近兩年的努力，張家川回族自治縣秦嶺三文魚自然保護區建設項目獲得省農牧廳批準。為合理保護和拯救張家川回族自治縣秦嶺三文魚資源，市政府向省政府申請在張家川縣建立省級秦嶺三文魚自然保護區，項目經省政府批準後即可實施。省農牧廳漁業項目評審委員會認為項目設計合理，既保護了水生野生動物的生存和人類對其的合理利用，又實現了人魚生態和諧和經濟可持續發展。秦嶺大馬哈魚自然保護區位於張家川馬鹿河流域，總面積85平方公裏，其中核心區19.5平方公裏，占22.9%，緩沖區62平方公裏，占72.9%，實驗區3.5平方公裏，占4.2%。項目規劃設計總投資568萬元。該項目已上報農業部，等待立項。秦嶺大馬哈魚自然保護區項目將為水生野生動物創造良好的生存環境，對拯救大馬哈魚起到積極作用。