在我國，柏樹的用途是很廣泛的，主要是用於觀賞、綠化、木材、入藥。
按照祖國傳統中醫的說法，柏樹發出的芳香氣體具有清熱解毒、燥濕殺蟲的作用，可祛病抗邪，培養人體正氣。據測試，其主要成分為菘萜、檸檬萜。這些天然物質不僅能殺滅細菌、病毒，凈化空氣，而且具有松弛精神、穩定情緒的作用。人們吸入柏樹的香味後，可使血壓下降，大腦血流量減少，抑郁情緒得到緩解。有些國家開展森林療法，讓癌癥病人到柏樹林中去休閑娛樂，多數患者精神狀態改善，有的還消除了化療引起的惡心嘔吐反應。但是山林中彌漫的豐富負氧離子，能夠起到提高人體免疫機能，調節呼吸和中樞神經系統的功能，還有著“空氣維生素”的美譽。
柏樹，可以說渾身都是寶，它的樹脂、樹油、果實、枝節、樹葉都能入藥使用。而以側柏的種子柏子仁和側柏葉在臨床上應用得最為廣泛。柏子仁性味甘、平，有養心安神、潤腸通便的功用。柏子仁配伍酸棗仁、茯神、地黃、當歸、五味子、遠誌、人參等，可以治療驚悸、失眠。另外，以柏子仁、大麻仁、松子仁適量搭配，研末服用，能夠治療老人或產後便秘。
柏樹的葉子性味苦、澀，寒，具有涼血、止血、祛風濕、散腫毒的功用。我們取側柏葉3700克，加水煮濃縮成1：2的稠膏，加入300克側柏葉細粉，烘幹，每次服2克，每日3次，治慢性支氣管炎，療效頗佳。新鮮側柏葉適量，水煎服，治百日咳，又治潰瘍病合並出血。如果把鮮側柏葉浸泡到70%的酒精中，然後用這個藥液塗擦毛發脫落處，能夠有效治療禿頂。