甲狀腺疾病患者能否接種新冠肺炎疫苗取決於患者的甲狀腺狀況。如果患者有甲亢危象或甲減危象，這種情況下是不可能註射新冠肺炎疫苗的。此外，患者在服用佩蘭期間不允許服用新冠肺炎疫苗。新冠肺炎疫苗可以在健康狀態下註射。如高血壓、糖尿病或有甲亢危象或甲減癥狀的患者，這種情況下不允許註射，以免對身體產生不良反應。
部分甲狀腺炎患者暫時不能接種新冠肺炎疫苗，待病情穩定後再接種新冠肺炎疫苗。甲狀腺炎主要包括橋本氏甲狀腺炎、急性甲狀腺炎和亞急性甲狀腺炎。橋本甲狀腺炎患者壹般可以註射新冠肺炎疫苗，只要患者沒有急性感染癥狀。對於急性甲狀腺炎和亞急性甲狀腺炎患者，如果患者處於發熱期，不建議註射新冠肺炎疫苗。
在《新冠肺炎預防接種技術指南》第壹版中，疫苗的禁忌癥包括發熱或急性病，以及慢性病急性發作控制不好的疾病。不建議註射新冠肺炎疫苗。由於急性甲狀腺炎和亞急性甲狀腺炎，壹種是細菌感染引起的，壹種是病毒感染引起的，患者可出現不同程度的發熱。暫時不建議這類患者接種新冠肺炎疫苗，待病情穩定後再接種。
自身免疫性甲狀腺炎不同時期飲食不同。甲狀腺毒癥期間，壹定要註意避免碘或低碘飲食。甲減期間要適當攝入含碘食物，如壹些海帶、紫菜、海魚等，都是含碘豐富的食物。約50%的自身免疫性甲狀腺炎患者終末期可伴有臨床甲減，可適當攝入壹些含碘食物，但需定期檢查甲狀腺功能水平。