中華人民共和國成立後，任應秋受到政府的重視和任命。1950任江津縣醫務工作者協會副主任，當選江津縣第壹屆人民代表大會代表。1952還受聘為重慶中醫學校教務主任、中央醫學會秘書長，並當選為重慶市人大代表；1957調入北京中醫學院任教。於6月1984+017年10月17日病逝於北京。1914 8月5日出生於四川省江津縣。
1931—1934江津醫學研究會研究。
1936—1938就讀於上海中國醫學院，後轉湖南中醫學院畢業。
1938—1942江津縣女子中學教師、校醫。
1941—1949擔任江津縣中藥協會常務理事。
1946—1949擔任全國中醫藥學會聯合會常務理事。
1952至1954，任重慶市衛生局高級中醫班教學主任。
1954—1957擔任重慶中醫學校教務主任。
1957—1984先後擔任北京中醫學院文獻編輯研究組主任、科研辦公室主任、各理論教研室主任、醫學史教研室主任、中醫基礎理論研究會會長。任應秋壹生閱讀了大量中醫古籍，尤其重視中醫古籍的理論研究，壹生致力於中醫理論的探索、整理和完善，取得了卓越的成就。
他壹直堅持認為，中醫不僅有豐富的臨床經驗，而且有相當完整的理論體系。針對社會上“中醫沒有理論”、“中醫不科學”的觀點，他深刻指出，中醫是經過億萬人民幾千年實踐檢驗的科學，為中華民族的繁榮昌盛做出了巨大貢獻。實踐證明，“道法更榮千年”，中醫不僅有其系統的理論體系，而且蘊含著深刻的整體觀、唯物論和辯證法，是自然形成的中醫理論體系。這是中醫最珍貴的部分。1978在《光明日報》發表題為《培養高水平的中醫理論骨幹》的文章，指出:“當前當務之急是如何發掘中醫寶庫中的理論，並加以整理和完善。”建議首先培養壹支精通中醫理論的高水平骨幹隊伍。方式是，無論是中醫學院的學生，還是西醫學習中醫的班級，都必須認真研讀幾部中醫經典著作。只有這樣，他們才有能力探索中醫理論，完成探索和完善中醫理論的艱巨任務。打好中醫基礎。從1961到1964，在《中醫雜誌》等醫學期刊上發表經典醫學著作學習輔導文章10余篇，系統介紹了《內經》、《難經》、《傷寒論》、《金匱要略》、《神農》等中醫經典著作。這些內容被重新編輯，更名為“學習中醫經典七講”，並納入任應秋的醫學文集。
任應秋歷來重視中醫經典著作的學習和研究，並取得了很大的成就。他以《內經》研究為例，綜合唐代醫家和後世王冰研究《內經》的方法，分為校勘、註釋、分類研究和專題發展，高度概括了前人的研究成果，從而總結出《內經》的學術思想和理論體系，指出《內經》全書主要包括臟腑、經絡、病機、病證、診斷、辨證等內容。他的理論體系的主要內容可以概括為臟腑(包括絡脈)、病機、診斷方法(包括四診)和治療原則四個方面，他研究的10個課題被寫成壹篇名為《內經十講》的論文，是他潛心研究《內經》幾十年的結晶，成為現代《內經》研究的主要參考資料之壹。為了便於研究《內經》，晚年他組織編寫了《內經章句索引》，成為中國歷史上第壹部研究《內經》的大型工具書。