但是關於營養的比較，這個說法太絕對了。微波烹飪會造成食物中部分營養成分的流失，但其實食物中的部分營養成分在任何加工過程中都會流失，不僅僅是微波加熱。在壹般的飲食中，對人體有益的營養素大致可以分為六大類:糖、蛋白質、脂肪、維生素、礦物質和水。為了減少微波烹調過程中營養成分的損失，保持原有的味道，應註意以下幾個方面:
1.用微波爐烹飪時，調料和油的用量要少。比如辣椒雞丁，在微波烹飪的過程中，油的量不揮發，所以調料的用量比傳統方法可以減少1/4。
2.做壹些程序，比如爆香，增稠等。，然後用微波加熱，這樣就可以擁有傳統烹飪的香味和味道。
3.控制加熱時間也很重要。壹般強度(650 ~ 800瓦)的烹飪，根據食物的多少和不同部位而不同:青菜三分鐘；梗四分半鐘；根莖六分鐘；豬肉六分鐘。
4.微波容器中的耐熱塑料和玻璃比瓷器和陶器煮得快；固體比液體煮的快，所以比如最好用熱水煲湯，用小碗煲湯，最快。
5.解凍後不要立即取出食物。等到表面的熱量滲透到食物裏面，這樣裏面就不會結冰了，解凍的程度可以用刀達到，避免營養流失。
6.選擇適合微波的烹飪方式，包括蒸、煮、煎、炸，以及燉、燜、煮等與水有關的烹飪方式，不適合微波烹飪。
微波加熱過程中微波殘留和泄漏。
任何事物都有利弊，微波技術也不例外。微波爐的使用給現代生活帶來了很多便利，但任何高科技產品都不可避免地有壹些特殊的使用方法。如果用法不對，產品的功能就發揮不出來，甚至會傷人。因為微波爐的頻率是2450 MHz，這樣的高頻波對人體有害，所以不允許開著門使用。使用微波爐時，為了觀察被加熱物體的狀況，只能通過裝有防輻射網的玻璃門觀察。即便如此，長時間在附近看它工作也不合適，其實也沒必要。最好是加熱後走開，等到預定時間自動關閉電源並按鈴，然後開門帶走暖氣。
有人擔心微波加熱的牛奶會有微波殘留。微波加熱的原理很簡單。它利用微波(所謂的電磁波)引發鮮奶中水分子的劇烈振動。由於振動，水分子相互摩擦產生高溫，使牛奶升溫。所以從其加熱方式理論上來說，不會對人體造成傷害。此外，牛奶加熱後，只有牛奶蛋白因加熱而輕微凝固(在蛋白質中加熱後的自然凝固現象)。當我們用傳統方式煮牛奶時，也會發現牛奶加熱壹段時間後，表面會覆蓋壹層奶皮。即便如此，這層奶皮吃起來還是安全的，不會影響體內的消化吸收效果，所以用微波加熱的牛奶應該是可以安全飲用的。
微波食品可能有致癌物質。
微波爐因其方便快捷成為現代快節奏生活的理想烹飪工具。在給人們帶來便利的同時，微波爐食品安全也成為消費者在使用微波爐過程中所關心的問題。其實微波加熱只是壹個物理過程。微波是壹種高頻波，以每秒24億次的速度旋轉，使水分子高速振蕩。它們相互摩擦產生巨大的熱量，可以快速加熱食物。根據量子力學理論，微波加熱過程並沒有破壞食物分子鏈的結構。只有當分子鏈的結構被破壞，食物分子分解成離子，重新組合成新的分子，原來的食物分子才會發生化學變化。微波加熱不能改變食物的分子結構，目前能證明的微波能量不足以發生化學變化，因此不可能產生新的未知分子。
這裏要註意的是嚴格按照微波爐的要求操作，最大限度規避風險，確保安全。特別提醒大家規範操作，正確使用。如果使用微波爐加熱的專用器具，不能使用紙質或金屬器具。紙容易燙壞食物，金屬質感可能會引燃，可能會導致食物燒焦，也可能會導致微波爐爆炸。如果食物被燒焦，會引起食物分子的壹些化學變化，對人體健康不利。