對於分支信道，仍然假設其分布範圍可以由其波動幅度確定的搜索窗口來確定。因此，對於有汊道的水系，仍可按照建立單通道骨架模型的方法對汊道進行分析。但此時搜索窗口中的航道條件數據不壹定是主航道沈積，而是分航道沈積，所以需要仔細分析搜索窗口中的條件數據。由於石油工業的特殊性，鉆井往往選擇優勢砂體，因此在主航道鉆井的概率遠遠高於支航道。因此，可以根據落入搜索窗口的信道條件數據量來決定它是主信道還是分支信道。當河道狀況數據超過規定值時，可暫時認為是主河道淤積。這是因為當同時存在上遊支流和下遊支流時，搜索窗口中的條件數據可能由兩條支流的條件數據組成，因此需要對條件數據進行分析。如果把河況數據分為上下遊兩組，上下遊情況數據很少，可能是支流河流；如果河道數據完全分布在上遊或下遊，由於找不到河道延伸的方向或源頭，可以暫時歸類為支流沈積。然後考慮離最近的主航道的距離，通過距離判斷是主航道還是分航道。如果在壹定距離內，則定義上下遊均為分支河道，否則視為主河道沈積。當落在搜索窗口內的河況數據不超過指定數量時，也需要分析這些河數據點。如果這些河流數據點與最近的主河流的中心線之間的距離超過壹定限度，那麽就可以用隨機數隨機確定它是支流還是主河流。如果離主通道中心線的距離不超過限定範圍，則認為是分支通道。
分支通道壹旦確定，就要判斷分支通道的延伸方向，屬於哪個主通道。
首先判斷分支渠道屬於哪個主渠道。根據條件數據點與主通道中心線的距離最小的方法，確定分支通道屬於最近的主通道。其次，根據這個條件數據點的位置，確定它是位於主河道的左側還是右側。第三，根據條件數據和源頭方向，確定是位於河流上遊還是下遊。如果它位於河流的上遊，那麽這條支流流入主河流。此時，使用搜索窗口沿著可能的流入方向搜索不屬於主流道或支流道的剩余條件數據點，如果落在搜索範圍內，則將該點加入支流道；如果是位於河流的下遊，那麽這條支流就是河流分叉造成的。同樣，使用搜索窗口沿著可能的分支方向搜索不屬於主通道或分支通道的剩余條件數據點，如果它們落在搜索範圍內，則將該點添加到分支通道。
需要註意的是，由於支流通道不壹定跨越整個研究區域，因此可以根據支流通道的延伸距離預先限定生成的支流通道的分布。支流通道可能會在其延伸方向上遇到其他主通道或支流通道。此時可以認為支流通道在此處匯入主通道或支流通道形成主通道或支流通道，合並後的支流通道延伸終止。
確定主航道和支流航道後，就可以預測航道的中心線了。利用壹維高斯函數生成河流中心線，預測方法類似於單條河流中心線，此處不再贅述。圖5-9是通過上述方法生成的具有分支通道的通道骨架模型。