1、母種的培養：香菇“母種”是指利用香菇的孢子、組織（菇肉）或菇木分離培養而成的菌種。香菇母種的培養，用馬鈴薯和洋菜做培養基。培養基的制作配方為：去皮的馬鈴薯（或甘薯）200克、葡萄糖（或蔗糖）20克、洋菜20克及水1千克 。按上述比例，把已去皮的馬鈴薯洗凈切碎後，放入鍋中加水適量煮沸20—30分鐘，用幾層紗布過濾去渣，把濾液加水至足量，再加入洋菜和葡萄糖，並加熱使之融化。接著趁熱分裝到試管中，管口塞上棉花並束紮成捆，包上牛皮紙，立置在高壓鍋內，在15磅壓力下維持30分鐘，或放在蒸籠中蒸2—3次（每日壹次，每次壹小時），同樣能達到滅菌的目的。將滅過菌的試管趁熱斜置在桌子上，待凝固後即成。
母種的培養要選擇出菇早，朵形正常，菇蓋厚，菇柄短胖，無病蟲害，7—8厘米成熟的香菇，放入接種箱（無菌箱）或接種室（無菌室）中，用刀片刮下表皮後，取幹凈無菌的菇肉約壹粒綠豆大，用接種針接到上述培養基上，壹管壹塊即可。將接種後的試管置於25—27℃環境（保溫室或溫箱）中培養，2—3天後在接種塊四周，就長出孢狀的白色菌絲。（試管內如發現有綠色、黑色等雜色菌或酵母狀東西，說明其中有雜菌，應把它淘汰掉。）約培養半個月後，菌絲體就布滿洋菜表面，母種培養即告成功。在分離和接種時，所用工具均需經滅菌處理。母種移到新的培養基上，進行擴大培養壹般稱之為“原種”。用作直接種到段木上去的菌種，壹般稱為栽培種。
2、栽培種的制備：目前香菇人工栽培所用的菌種，主要是木屑菌種和種木菌種二種。
⑴制備木屑菌種的培養基配方為：適合香菇生長的各種硬質什木的幹木屑7.5千克，米糠或麩皮2.2千克，蔗糖0.15千克，石膏粉0.15千克及水15千克。按上述比例，把木屑、米糠先拌勻，把蔗糖和石膏粉溶在10千克水中，然後倒入上述混合物中和勻，再將余下的5千克水加入調勻隨即分裝到菌種瓶中，至近瓶肩，稍壓實（下部稍松，上部稍實），再用尖形木棒鉆壹個直達瓶底的洞孔。然後瓶口塞上棉花塞，並用牛皮紙紮起棉花塞，移到蒸蘢中續蒸4—6小時（從水開算起，火要猛）、或放在高壓鍋中，在15磅壓力下維持1小時，進行滅菌。滅菌後，取出冷卻，即可用來接種。接種過程要在無菌條件下操作，用接種針挑取經過擴大培養的原種1小塊，接種在上述的木屑培養基上，接種後把它放置在25—27℃環境中培養壹個月左右（或20—25℃培養1—2個月），待菌絲體長滿全瓶後，即可接種到段木上去。
⑵種木菌種的制備：香菇的種木菌種，主要是三角木和圓木兩種。三角木是把適合種香菇的木材加工成厚0.8厘米、寬1厘米的木條，然後再加工成三角木塊（規格是：厚0.8厘米、寬1厘米、高1—1.5厘米）。圓木是先把木材橫鋸成1.2厘米的木片，再用皮帶沖壹個壹個沖下來。加工出來的三角木或圓木，應立即曬幹備用。做10千克幹種木用的培養基，要配木屑2千克，米炕（或麩皮）1千克、蔗糖0.1千克、石膏粉0.1千克、水4.5千克。先把幹種木浸在1%糖溶液中12—24小時或放在鍋中煮開15—20分鐘後，撈出種木，與四分之三的混合物拌勻，並隨即分裝入菌種瓶（或其它瓶）、用余下的四分之壹蓋面，裝至瓶肩、稍壓實、壓平，塞上棉花塞，其消毒接菌和培養方法與木屑菌種同。經壹段時期培養後，即成為三角或圓木菌種。
二、段木的接種與栽培
1、菇場的選擇要從溫度、濕度、光線、通風等方面考慮，最好選坐北朝南的緩坡或開闊地，要求靠近水源，排水良好，地面幹爽，土壤以含石礫較多的酸性砂質土為宜，上面要有高大的遮蔭樹或遮蔭棚，菇場四周要開歡排水溝。我國能長香菇的樹種約200多種，殼鬥科和樺木科是比較理想的樹種，楓樹、橡樹、白樺樹也可作樹種 。砍倒的菇木讓其自然風幹後，壹般幹燥到樹心出現幾條短裂紋時為適度，再鋸成段木接種。
2、人工接種從12月至次年3月均可進行，1—4月份最適宜。接種前應除去菇木枝椏，將原木鋸成壹米長的段木，並在斷口處塗1%的石灰水消毒。接種方法：
⑴用皮帶沖打孔，孔穴至少要深入木質1厘米以上，壹般株距20—30厘米，行距6—10厘米；
⑵將菌種放入穴中，用手指稍加壓實；
⑶將事先準備好的樹皮蓋（略大於孔）蓋在孔蓋上，用鐵錘輕輕敲打，使之緊緊塞住孔穴口。菌種要當天開瓶當天用，才不會沾染上雜菌。冬季接種後的菇木，應緊密堆放在菇場背風溫暖處，四周用尼龍紙圍住，上蓋樹枝，每隔3—5天掀動尼龍紙壹次使之換氣。20天後，如接種孔邊緣長出白色菌絲，說明菌絲已定植成功。發菌期持續1—1.5個月左右。
3、養菇期包括春、夏、秋三個季節。春夏季著重防雨和防曬，主要做好段木的堆放和翻動以及遮蔭等工作。壹般2—3個月翻堆壹次，如長期陰雨，放晴後要立即翻堆。整個養菌期內，絕對不能讓太陽直接，但要有壹定的散射光。通常利用天然林的高大樹木遮蔭或用樹枝、樹皮及其它覆蓋物蓋在菇木堆上，也可搭棚遮蔭。秋季菇木管理則以保溫為主，表層可適當幹燥，促使菌絲向深層生長，擴大菌體的營養範圍。霜降前後加強出菇期的管理，當日平均溫下降到15℃左右時，將秋季熟的菇木搬出菇場，重新架木，補淋水以促進出菇。淋水後的菇木，如遇10℃以下低溫，應堆放在向陽處，用尼龍紙或草席緊緊覆蓋，直至大量菇蕾長出時，再散堆架木。
采菇後的段木要移回養殖場堆放，按常規養菌方法管理，並特別註意防治病蟲害，防潮、防曬，讓菇木的菌絲繼續生長，使來年再度正常產菇。
采菇時節壹般在香菇長至七、八成熟，形成銅鑼邊時。即及時采摘。采菇應選擇晴天進行，將整朵香菇連根摘下，並及時烘曬幹燥。商品香菇幹燥程度須達到含水量約18%，以便長期保存。目前多采用火力幹燥，也有采用半曬半烤的辦法。