其中，塞爾維亞人對穆斯林的“種族清洗”尤其受到外界關註，尤其是在波黑戰爭接近尾聲的7月，1995，塞爾維亞軍隊攻占了波黑東部塞族控制區的波什尼亞克飛地斯雷布雷尼察，在兩周內屠殺了約8000名波什尼亞克男子。這被認為是二戰結束以來歐洲最慘烈的大屠殺。
1995 165438+10月，在美國的主持下，南斯拉夫、克羅地亞和波黑領導人簽署了波黑代頓和平協議，波黑戰爭結束，最終雙方在波黑的旗幟下形成了穆斯林聯邦和塞爾維亞共和國兩個控制區。波黑戰爭是第二次世界大戰後歐洲爆發的最大規模的局部戰爭。波黑430萬人口中，27.8萬人死亡，200多萬人淪為難民。
波黑戰爭開始後，控制軍隊的波黑塞族得到了由前南斯拉夫塞爾維亞共和國和黑山共和國重組而成的南斯拉夫聯盟共和國的支持，擁有坦克、大炮、飛機等重武器(穆斯林和克羅地亞族在戰爭初期基本沒有重武器)，軍事優勢明顯。毫無防備的穆斯林城鎮和村莊到處著火，塞族士兵整輛車沖進穆斯林城鎮和村莊燒殺搶掠。所有男性穆斯林都被捆綁在車上，運送到秘密地點進行肉體毀滅，被各界稱為精心策劃的種族滅絕。穆斯林被迫組織起來抵抗，並向全世界發出求助的呼籲。波黑戰爭期間，在民族情緒的煽動下，許多原本和睦相處的鄰居因為民族和宗教的分歧反目成仇，自相殘殺。薩拉熱窩是壹座群山環繞的城市。從周圍的山上，妳可以清楚地看到幾乎所有的城市。當這座城市被塞族人圍困時，壹條繁華的街道矗立在城外山上的狙擊手面前，因此被稱為“狙擊手街”。這條街上的行人是狙擊手的最佳目標。只要他們看到有人走或者發現壹個人影，子彈就會從山上飛來。因此，今天薩拉熱窩的許多街道，包括沿街的居民樓，仍然布滿彈痕。
也許很多人都聽過港歌手鄭秀文唱的《羅米歐與茱麗葉在塞拉熱窩》這首歌，“愛，不論宗教，從來不怕槍，往往寧願愛妳壹輩子到死……”但並不是所有人都知道，這首歌的背景源自薩拉熱窩的壹對外國戀人:阿米拉(Admira)和博什科·布爾基奇(Boshko Brkic)，他們在波黑戰爭中為躲避戰火被槍殺。雖然當年戰爭的痕跡已經褪去，但兩個人勇敢跨越種族隔閡，相戀至死的故事依然存在幸存者心中。阿米拉和布爾基奇是青梅竹馬。前者是波什尼亞克人，後者是塞爾維亞人，但這並沒有阻止他們相愛，期待未來幸福的婚姻。他們相戀9年，直到25歲波黑爆發內戰，薩拉熱窩被塞族軍隊圍困，他們被迫相約逃亡。1993 5月18日，他們兩人在槍林彈雨中穿越弗爾巴尼亞大橋時被槍殺，死前壹刻緊緊相擁，因此被形容為“薩拉熱窩的羅密歐與朱麗葉”。這樣壹抱就是八天，因為在這期間誰也不能安全地把屍體搬走下葬。