1.PCR-瓊脂糖凝膠電泳結果:實驗設計的引物擴增Myc 3種基因,經PCR擴增,喉癌組織及正常組織細胞DNA在瓊脂糖凝膠上均可見2條小於300 bp 的電泳帶。第1條帶為N-myc( 230bp)和L-myc(227 bp)2個DNA片段合成帶,因兩者只相差3 bp,故瓊脂糖凝膠電泳不能將其分開而呈現1條帶;第2條電泳帶為C-myc基因(244 bp)。 將電泳結果拍照後的底片在激光掃描儀進行掃描,得出2條帶的峰面積值。正常組織細胞的C-myc帶比N-myc和L-myc合成帶密度弱,比值小於1,求出正常組織細胞的C×(N+L)均值為0.6 。
C-myc擴增倍數=喉癌的C×(N+L)×0.6,考慮實驗中的綜合因素,定為1.5倍以上有C-myc擴增。結果顯示:喉癌中有42%的C-myc擴增,正常組織細胞沒有C-myc的擴增。
2.PCR-中性聚丙烯酰胺凝膠電泳結果:由於中性聚丙烯酰胺凝膠電泳對DNA的分離特性,經PCR擴增後的Myc基因電泳帶顯示3條。第1條帶為L-myc(227 bp),第2條為N-myc(230 bp),第3條為C-myc(244 bp) 。將擴增出特異性Myc基因電泳帶的凝膠片,直接在激光掃描儀上進行掃描,得出3條帶的峰面積值。然後用各自的峰面積值除以各自的堿基數,作為該基因的單拷貝數,將L-myc、N-myc和C-myc三者中最小的單拷貝數設定為1,比較其他2個基因的相對倍數。正常組織細胞L-myc∶N-myc∶C-myc均值為1.0∶2.2∶3.8。結果32例喉癌中47%有L-myc和C-myc的擴增,41%有N-myc擴增。C-myc的擴增率與用PCR-瓊脂糖凝膠電泳檢測的結果基本壹致(χ=0.254,P>0.614)。 1.標本:32例喉癌組織取自我院耳鼻咽喉科住院病人,7例正常喉組織取自我科同期住院的非癌癥病人,3例正常白細胞取自我院血庫人全血。所有標本均經病理證實。根據喉癌組織病理分化程度不同,分為高、中、低分化癌。
2.PCR引物:5′-CCCAGCGAGACATCTGGAAGAA-3′,5′-GAGAAGCCGCTCCACATGCAGTC-3′。擴增Myc基因家族的3個基因,即C-myc(244 bp),N-myc(230 bp),L-myc(227 bp),由上海復旦大學遺傳學研究所合成。
3.試劑:TaqDNA聚合酶、dNTP為Promega公司產品;蛋白酶K為Merke公司產品;硝酸銀為沈陽試劑二廠產品;Marker PUC 18質粒DNA HeaⅢ酶切片段為Sigma公司產品。 1.模板DNA提取:參照參考文獻[3]方法進行。
2.PCR擴增:PCR擴增總反應體積50 μl,應用模板DNA 50 ng,在DNA擴增儀操作(Perkin Elmer Cetus),循環周期為94℃1分鐘,55℃1分鐘,72℃2分鐘,經過30個循環後,補加72℃7分鐘。
3.瓊脂糖凝膠電泳步驟:取PCR產物5 μl加1μl上樣緩沖液(0.25%溴酚藍,0.25%二甲苯氰FF,40%蔗糖水溶液)之後備用。制備2%瓊脂糖凝膠倒入水平式電泳槽中。待膠凝固後加樣,用1×TAE緩沖液作為電極緩沖液,溴化乙錠染色,電壓低於5V/cm,時間約為2小時。電泳結束後,凝膠直接在紫外透射儀上觀察結果。照像,拍片後的底片在激光掃描儀上進行掃描。
4.非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳步驟:取PCR產物5 μg加1 μl上樣緩沖液之後備用。制備8%非變性聚丙烯酰胺凝膠,灌註於20 cm×20 cm×0. 1 cm垂直板電泳槽中, 待凝膠聚合後加樣,用1×TBE緩沖液作電極緩沖液,室溫下電泳1瓦特約14小時,待指示劑溴酚藍移到邊緣時停止電泳。將電泳後的凝膠移至方盤中進行硝酸銀染色。染色過程如下:用雙蒸餾水(dH2O)洗凝膠3次後浸泡於染色液(硝酸銀1g,加dH2O至500 ml)中30分鐘,去掉染色液,用dH2O漂洗3次凝膠,然後浸泡於顯色液(NaOH15g,38%甲醛3.8 ml,加dH2O至500ml)中約10分鐘,當顯出棕黑色DNA區帶時,用dH2O洗1次凝膠後,浸於停影液(冰醋酸25 ml,加水至500 ml)中約30分鐘,然後把凝膠移至固定液(乙醇25 ml,冰醋酸2.5 ml加dH2O至500 ml)中固定。固定後的凝膠在看片燈上觀察結果、拍照片,凝膠直接在激光掃描儀進行掃描。
,3者在第2外顯子中有2個區域高度同源,3個基因分別表達各自獨立的蛋白,它們的生理作用基本壹致。研究表明,在許多腫瘤細胞中有Myc基因擴增或異常表達,但在不同的腫瘤組織和癌細胞系中,Myc基因家族的成員在擴增或表達方面有些差異。因此,深入研究Myc基因3個成員與人類腫瘤的關系非常有意義。本研究建立的PCR-非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳-激光掃描技術,可同時檢測腫瘤組織中3種Myc基因的擴增情況,在腫瘤發生發展過程中,為進行3種基因各自作用機理的研究提供了簡易的實驗手段。