1、反式脂肪酸的危害大
奶精主要是植脂末、植脂乳做成的，它在制作過程中是不加任何牛奶的，只是在植物油中，加入了水和各種添加劑混合，經過調配、乳化、殺菌和幹燥之後，制作成類似牛奶的東西。
奶精中所含的反式脂肪酸不易被人體消化吸收，長期在體內的積累，就會促使肥胖的發生。
反式脂肪酸還含有較高的熱量和膽固醇，對人體有很大的危害。
同時還會增加血液的粘稠度，對記憶力有壹定的損害。如果長期攝入過多反式脂肪酸就會增加女性不孕不育。
2、常喝屯脂肪
多喝奶茶對人體有很多壞處，奶茶是高糖、高油、高熱量，沒有營養價值可言，算壹種垃圾食物。奶茶加的奶精，多由椰子油制成，喝多了容易發胖，脂肪容易堆積在肚子上，形成中廣體形。
3、影響幼兒智力發育
珍珠奶茶中的香精和色素雖是按照國家食品添加劑標準添加的，但喝多了就有危害。尤其是幼兒。特別是對孩子智力發育和行為健康。
4、容易患上慢性病
椰子油中含大量飽和脂肪酸，會加速體內制造膽固醇，血脂肪也會急速上升，形成血管硬化，長期大量飲用，容易罹患高血壓、糖尿病等慢性病。
曾有統計數字顯示，大量飲用奶茶超過三個月，血脂肪及膽固醇都會升高。
奶茶只是油和糖的結合，因為奶精並非牛奶制成品，奶茶中又有大量糖分，幾乎不含鈣還對身體有很大的傷害。
奶茶最好不要天天喝，壹周頂多喝個壹、兩杯解個饞即可。所以說奶茶不能多喝。
5、珍珠奶茶營養很低
正宗優質的珍珠奶茶壹般采用鮮奶或奶粉+冰糖或蔗糖+紅茶+純凈水+木薯粉制成的“黑珍珠”調配而成。
但後來因為競爭激烈，個別商家開始動腦筋，從口味上、成本上下工夫。
2009年的時候，就有報道說，有些色香味俱全的珍珠奶茶事實上只是用幾種粉末勾兌而成，奶精(註：不是奶粉，更不是鮮奶)、塑料、芒硝和工業氯化鎂等化學品竟成為部分珍珠奶茶的主打原料。
壹家連鎖珍珠奶茶店的老板說，珍珠奶茶中的黑色小圓，他們稱之為珍珠粉圓，公開的主材料是木薯澱粉，但單純的木薯澱粉並不能讓珍珠彈性十足，如今比較通用做法是在其中加入小麥蛋白。
即便如此，有的商家也覺得彈性還不夠，為了讓珍珠更有“嚼頭”，於是再添加人工合成的高分子材料。
“說白了，高分子材料就是塑料，這也是行業內心照不宣的秘密，這樣的成分不可能被人體吸收。”
而營養學家及醫生們，對珍珠奶茶的營養價值，壹直評價很低。
營養學專家曾在《飲食科學》雜誌上撰文《粉碎珍珠奶茶的營養神話》中說，珍珠奶茶中的奶精，所含的牛奶成分微乎其微。
它不能補鈣，更不能補充蛋白質，只會提供糖分和脂肪。特別是脂肪含量高達40%-75%。最糟糕的是，奶精中的氫化植物油，這是壹種反式脂肪酸，喝多了，不僅會影響心腦血管健康，還可能增加乳腺癌和糖尿病的發病率。
專家說，偶爾喝杯珍珠奶茶不會對身體帶來大的損害，但她提醒兩歲以內的幼兒不宜飲用珍珠奶茶，學齡前的小孩也盡管少喝。
6、珍珠奶茶的危害
(1)增加心血管患病風險
很多珍珠奶茶都是用奶精調制的，而奶精中含有氫化植物油，因此可能含有反式脂肪。過多攝入反式脂肪酸可使血液膽固醇增高，從而增加心血管疾病發生的風險。不過，據調查顯示，每100克奶精的反式脂肪平均含量只有0.41克，偶爾喝壹次奶茶倒不用擔心會危害健康。
(2)可能引起過敏
珍珠奶茶中的珍珠為了有好的口感和嚼勁，會添加壹些小麥蛋白。小麥蛋白是壹種蛋白質，對小麥過敏的人，可能會因為食用含小麥蛋白的珍珠引起過敏，但對其他人則沒有危害作用。
(3)可能損害肝臟
珍珠奶茶會添加甜蜜素作為甜味劑，這是壹種無營養的化學合成物，甜度是蔗糖的40-50倍。食用甜蜜素超標的食物，可能會損害肝臟和神經系統，但珍珠奶茶中甜蜜素含量很低，每天大約喝100杯才會超過安全量。
(4)含其他添加劑成分
珍珠奶茶還含有芒硝、氯化鎂等食品添加劑成分。氯化鎂是作為凝固劑和穩定劑使用的，也常用於豆制品的加工制作中。這兩種成分對人體都沒有明顯的危害作用。