民國初年，少林寺尚有僧眾二百多人，土地壹千三百七十余畝，度日艱難。 民國五年（1916年），有王雲華修葺緊那羅殿之舉；民國八年（1919年），寺僧又修繕了白衣大士殿及地藏王殿，但都屬小規模的修修補補。
當此之時，軍閥混戰，武人朝秦暮楚；土匪肆虐，無賴劫奪流竄，寺僧惟以寺宇平安為念。時有雲松恒林和尚（1865～1923年），為寺宇平安做出了貢獻，但也由此種下了禍根。
恒林，伊川縣宋寨人，俗姓宋氏，光緒元年（1875年）入寺燕染。民國元年（1912年），為登封縣僧會司。其參禪之外，又習拳術，武藝高超。因地方不靖，縣府便命他為“少林寺保衛團團總”，系地方民團性質。他只好“以菩薩心腸作金剛面目”，購置槍械，訓練僧兵，以備不虞。 民國九年（1920年）秋，歲遭旱荒，土匪蜂起。恒林率民團在登封縣城、梯子溝、白玉溝等處，與土匪大小數十戰，打落“肉票”多人，每次皆獲勝利。壹次，土匪桿首朱保成、牛邦、孫天章、段洪濤等合夥夜襲鞏縣魯莊鎮，天將明時被發覺，向西南逃竄。鞏縣九區民團緊緊追擊。匪過偃師府店，偃師縣十四區、十五區民團也加入追擊隊伍。土匪逃至少林寺西熬子坪，遭恒林所率少林寺民團截擊，大部被消滅。這次戰鬥繳獲槍支、彈藥甚多，皆藏於少林寺內。
恒林因其英勇善戰，名聲大振。土匪不敢犯境，環寺數十村得以安居樂業。時河南省政府主席張鳳臺授恒林以獎狀、獎章，並向少林寺緊那羅王殿獻了“威靈普被”的匾額，以謝神庥。河洛道道尹閻倫如也送了“少林活佛”的匾額，旌表恒林剿匪之功。恒林則謙恭如壹，敦睦百姓。
民國十二年（1923年）十月初二日，恒林因積勞成疾去世，春秋五十九歲。次年春，登封、鞏縣、偃師、臨汝四縣民眾三百余人集資為恒林立碑悼念。 恒林去世以後，他的弟子妙興（1891—1927）接任了登封縣僧會司及少林寺保衛團團總的職務。
妙興，字豪文，俗姓金，臨汝縣謝灣村人，家境貧寒，八歲（1898年）投少林寺恒林為師，自幼學拳習武，技藝超群，綽號“金羅漢”。 民國十四年（1925年）二月，豫西爆發了“胡憨之戰”。陜西的劉鎮華派憨玉琨率軍入河南，與河南督軍胡景翼作戰，爭奪中州。胡部樊鐘秀派蘭世勛運動駐偃師的憨部李慎亞倒戈。當憨部崔繼華自密縣退卻時，妙興率部隊幫助李慎亞攻打崔繼華，大大支援了樊鐘秀。自此，妙興與樊鐘秀關系更加密切。
民國十五年（1926年)七月，廣州革命軍開始北伐。九月，馮玉祥（1882～1948年）宣布脫離北洋軍閥，參加國民革命。吳佩孚聯合張作霖（1875～1928年)攻打馮玉祥，被北伐軍擊敗。次年（1927年）春，馮玉祥占領西安，配合北伐軍合攻河南。二月，妙興所率第壹團奉命開往鄭州，又調往舞陽。三月六日，在與任應岐部交戰中，妙興陣亡，年僅三十七歲。六月，遺體由弟子體信運回少林寺，葬於寺東北山坡上。