《塵埃落定》取材很民族化，這與作家阿來本就是藏人以及他的生活經歷有關。盡管如此，小說中涉及到的權力、英雄、愛情等，皆刻畫描寫得深入人心。
壹個聲勢顯赫的麥其土司，在酒後與漢人太太生了壹個傻瓜兒子，壹個從小到大都被人堅定是傻子的兒子。可是在很多事情上，這個傻瓜又做的比很多聰明人還要精明。這讓我們不禁納悶了，這個傻瓜是真傻還是裝傻？又或者他是大智若愚？又或者他所為的那些精明的事是偶然的？
在《塵埃落定》中，我們仿佛可以穿越回到那個土司制度的時代。每個土司就像壹個土皇帝，在他們各自的領地上，掌握著生死予奪，掌握著金錢、奴隸和權力。土司們都有壹個堡壘似的官寨，裏面有奴隸，有喇嘛，有金銀財寶，有行刑人和行刑臺……
麥其土司的傻瓜兒子與現實中的生活格格不入，卻有著超時代的預感和行為舉止，常常不按常理出牌。
麥其土司因為種植罌粟而變得空前強大，而後其余的土司也效法他種植，傻子卻突然建議種麥子。結果是，鴉片供過於求，無人問津，種罌粟的土司的領地上都出現了災荒，唯獨麥其土司幸免於災。後來大批災民爭相湧來投靠傻瓜，傻瓜最終在邊境上開起了貿易市場，建立起壹座新的城鎮。
壹個傻子，往往不愛不恨，因而通常只看到基本的事實。這樣壹來，容易受傷的心靈也因此處於壹個相對安全的位置。因為是壹個傻子，之前壹直得到哥哥的真心愛護，因為將來麥其土司是要傳給聰明的哥哥的。可是後來，傻子又好像不傻，從而與哥哥陷入了權力的鬥爭中去。可是就是這樣壹個傻子，似乎無欲無求，但最後卻在哥哥被仇人殺死後，成了土司的繼承人。
妳說傻子傻吧，他很多時候所表現出來的行為確實很傻；可是妳說傻人有傻福吧，他使得很多別的土司的人都歸順了他，也得到了自認為是世界上最漂亮的女人塔娜做妻子。
傻子跟塔娜的愛情是比較悲劇的。茸貢女土司在災荒的時候，為了得到傻子的糧食，以女兒作為誘餌。傻子壹眼就愛上了她，可是塔娜這樣壹個漂亮無比的女人又怎麽會情願嫁給壹個傻子呢？是迫不得已的。之後塔娜好幾次都背叛了傻子，可是最後他們仍舊是在壹起的。
傻子是幸運的，成長的路上，有很多人都陪伴在他身邊。桑吉卓瑪，是他的第壹個侍女，教會了他男女之事，讓他明白初戀的滋味；行刑人爾依和奴隸索郎澤郎對他忠心耿耿，壹直是他的左膀右臂；書記官翁波意西，這個熱心於傳教的人，教會了他許多事理，啟發他、教導他；跛子管家，幫助他打理生意上的各種事務，是他的得力助手；當然，還有他的母親，為了這個傻瓜兒子，可謂是操碎了心。
傻子是壹個時代的見證者，也是壹個時代終結的見證者。在黑頭藏民生活的地方，土司制度由來已久，誰也不會想到這種制度會瓦解，但傻子卻像壹個預言家，預示了自己將是最後壹個土司。
隨著“白色漢人”的失敗，“紅色漢人”的勝利，麥其土司的巨大官寨，以及其他土司的，在隆隆的炮聲中，土崩瓦解。而傻子也被仇人的匕首給紮進了肚皮，“血滴在地板上，是好大壹汪，我在床上變冷時，血也慢慢地在地板上變成了黑夜的顏色。”
塵埃落定之後，壹個舊的時代落下了帷幕，而壹個新的時代正即將到來……