銀杏具有重要的食用和藥用價值。銀杏果實營養豐富，具有天然保健功能。長期食用可以延緩衰老，延年益壽。在藥用價值上，明代李時珍曾說:“入肺經，益脾氣，平喘止咳，減少排便。”銀杏果含有黃銅苷、銀杏酸等多種成分，具有抗結核、抗真菌、抑制癌細胞擴散的作用。銀杏葉的成分很復雜。到目前為止，已知化學成分的銀杏葉提取物有160多種，主要包括黃酮類、酚類、生物堿類、銀杏醇等。醫藥行業主要從銀杏葉中提取巴西內酯，如6911片、舒血寧片，臨床用於治療冠心病、心絞痛、心腦血管疾病。銀杏果實和葉提取物也具有美容效果，可用於制備美容產品。目前市場上用它們配制的護膚護發產品有50多種。此外，銀杏的根和樹皮也可入藥，治療白帶遺精等疾病和壹些家畜疾病。銀杏皮含有氫化銀杏酸、銀杏黃酮等化學成分，可作為醫藥原料。
銀杏的生態價值體現在適應性強、抗汙染、抗蟲害。是農田防護林、道路防護林、護岸林、林糧間作和“四面”綠化的理想樹種，在凈化空氣、涵養水源、防風固沙、改善農田小氣候等方面具有重要作用。同時，銀杏樹具有很強的觀賞價值。其樹姿挺拔，葉片精致奇特，集葉、冠、莖之美於壹身，融自然景觀與人文景觀於壹體。它在綠化城鄉、美化園林、創造自然景觀等方面遠遠優於普通綠化樹木，壹直受到植物學家和景觀學家的重視。目前，銀杏樹已被日本、韓國和我國許多大中城市指定為城市綠化的首選。銀杏盆景還以其外在的形式和獨特的造型，如粗枝、彎枝、露根等，表現出蒼勁、古樸、曲折的意境。十分詩情畫意，是盆景中的上品，被世人譽為“立體畫、無聲詩”、“活的藝術”。
銀杏木材質量高，價格貴。素有“銀香木”之稱，其木材價值可見壹斑。銀杏木紋平直，不翹不裂，易加工，有特殊的藥用香味。它屬於壹等木，是工藝雕刻、室內裝飾和制作名貴家具、畫板的壹等原料。由於銀杏木材產量很少，國際市場價格壹般為30萬美元/立方米，國內價格也在萬元以上。據專家測算，20年生銀杏人工用材林每畝可產木材12立方米，按每立方米35000元(國內現價的30%)計算，每畝產值42000元。
銀杏還有珍貴的科研價值。銀杏的起源、進化、生物學特性、生長發育規律，基本囊括了植物形態學、植物遺傳學、植物生理學等學科的所有研究課題和主題。通過對銀杏的研究，人類將能夠更加深入和全面地揭示植物的進化和遺傳。近年來，許多人壹再提議將銀杏樹定為“國樹”。