商品及服務稅-下拉原則
?GST下拉實驗是基於GST(谷胱甘肽-S-轉移酶),即谷胱甘肽-S-轉移酶蛋白,可與谷胱甘肽結合。將GSH固定在瓊脂糖珠上形成GSH-瓊脂糖珠,通過與GST融合表達已知的蛋白質X。獲得的GST-X可以與GSH-瓊脂糖珠結合。如果環境中有蛋白質Y與蛋白質X相互作用,就會形成“瓊脂糖珠-GSH-GST-X-Y”復合物,可以分離檢測與蛋白質X相互作用的蛋白質。
GST下拉實驗方法
(基於鐘鼎的實驗案例,驗證預測的兩種蛋白質之間的相互作用)
試驗設計
表1拉下實驗系統
編號1 2 3 4
商品及服務稅++
B-His-+-+
商品及服務稅- +-
試驗設計
1.IPTG誘導pET28a-B-His和pGEX-4T-1-A載體融合蛋白的表達。
將1.1的表達載體轉化到大腸桿菌Rosseta中;
1.2選擇轉化板上的單克隆抗體,接種於含有50 μg/mL Amp的3 mL LB培養液的試管中,37℃搖勻過夜,制成種子液;
1.3次日,將1:100接種於含50 μg/mL Amp的30 mL LB培養基中,37℃搖床至OD600為0.8。
菌液中加入1.4 IPTG至終濃度0.5 mM,11~28℃振蕩培養,誘導融合蛋白表達4 ~ 8小時;
1.5離心菌液,棄去上清液,細菌沈澱用PBS重懸,超聲波破碎,離心取上清液;
1.6吸取少量上清液進行SDS-PAGE檢測目的蛋白的表達。
2.細胞破碎和蛋白質純化
分別通過超聲波破碎、GST柱親和純化和Ni柱親和純化獲得純化的目的蛋白。
2.1 GST柱純化
(1)使用低壓層析系統,將細胞裂解上清液加載到GST親和層析柱上,GST結合-緩沖液預平衡;
(2)用GST結合緩沖液洗滌色譜柱,直到流出液的OD280值達到基線;
(3)用GST洗脫緩沖液洗脫目的蛋白,收集流出液;
(4)將收集的蛋白溶液加入透析袋中,用Tris-HCl透析過夜;
(5) SDS-PAGE分析和WB分析。
2.2鎳柱凈化
(1)使用低壓層析系統,將細胞裂解上清液加載到具有Ni-IDA結合緩沖液預平衡的Ni-IDA -Sepharose Cl-6B親和層析柱上;
(2)用Ni-IDA結合緩沖液洗滌色譜柱,直到流出液的OD280值達到基線;
(3)用Ni-IDA洗滌緩沖液洗滌色譜柱,直至流出液的OD280值達到基線;
(4)用Ni-IDA洗脫緩沖液洗脫目的蛋白,收集流出液;
(5)將收集的蛋白溶液加入透析袋中,用Tris-HCl透析過夜;
(6) SDS-PAGE分析和WB分析。
3.GST-下拉實驗
使用Gst蛋白質相互作用下拉試劑盒(購自Thermo company)。
3.1平衡樹脂(GST)
(1)將固定化谷胱甘肽混合均勻,使樹脂完全重懸;
(2) 100每個?將L 50%樹脂懸液置於4個離心管中,1250 ×g離心2 min,棄去上清液;
(3)用500?l將樹脂重新懸浮在PBS中,在1250 ×g離心2分鐘以去除上清液,並重復3次。
3.2蛋白質相互作用
(1)按表1分別向谷胱甘肽樹脂中加入A-GST蛋白和B-His蛋白,4℃下旋轉混合,孵育過夜;
(2)1250×g離心5 min後,棄去上清液(上清液要清洗幹凈);
(3)用500?PBS重懸浮樹脂。用1250×g離心2分鐘,棄去上清液。重復3次。
3.3誘餌蛋白和目標蛋白復合物的洗脫
(1)加50?l洗脫緩沖液;
(2)在2)4℃下旋轉和混合,並孵育20分鐘;
(3)在1250× g離心2分鐘,棄去上清液,將離心後的液體置於冰上;
④拿20?l樣品用SDS-PAGE和WB檢測。
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