1，不同來源:瓊脂直接從紅藻中提取，瓊脂糖是在瓊脂中加入蔗糖加工而成。
2.顏色不同:瓊脂無色淡黃色，瓊脂糖白色。
3.穩定性不同:瓊脂糖比瓊脂更穩定，能耐受更高的熱量和酸堿環境。
4.作用不同:瓊脂糖營養豐富，無論溫度、酸堿，都可以用於制作食品、醫藥等領域。瓊脂的應用範圍要小得多。