1，香味:茴香菖蒲有很濃的茴香味，石菖蒲沒有這種香味。
2.顏色:茴香菖蒲根莖呈紫紅色，而菖蒲根莖呈黃色或黃褐色。
3.葉形:菖蒲的葉形更接近細長的條狀或線形，而菖蒲的葉形更接近劍形。
4.功效:石菖蒲具有健胃健脾、化痰止咳、活血化瘀、提神醒腦等功效，而石菖蒲茴香具有行氣止痛、祛風除濕等功效。