丁勉潛入古墓，挖出南越國用來占蔔的聖物九星輪，卻無意間觸碰了機關，四方火箭飛射，丁勉險些被埋在古洞裏。丁瑤感覺今天是自己最倒黴的壹天，論文答辯吉兇難測，還不知道能不能順利過關；出校門就被汽車濺了壹身水；還被人壹撞，撞丟了壹只隱形眼鏡.丁瑤郁悶萬分，發誓晚上要出去大吃壹頓，去去晦氣。丁瑤半路回家接到父親丁博士電話，丁勉還在繼續探索南越古國的遺址，但已經派人把九星輪送回了研究所。
女媧傳說之靈珠第2集
丁勉和林風回到研究室，發現研究室壹片混亂，九星輪發出異樣光彩，丁瑤不知去向。丁勉則望著九星輪發楞，懷疑女兒進入了時光隧道。而三千年前的南越國國王卻認定眼前的丁瑤便是已故大祭司仙樂的轉世。原來壹切都是傳說中的定數，預言註定仙樂轉世將再次降臨人世，丁瑤看過仙樂遺體後更印證了這壹說法。榮狄給丁瑤講敘了過去發生的事情：從盤古開天地講到她的前世仙樂是如何來到人間又被剔除仙骨的。
女媧傳說之靈珠第3集
魔音接到選擇良辰吉日迎娶王後的聖旨大怒，衛遼也懇請哥哥榮狄三思，但榮狄執意要娶丁瑤，將弟弟趕出宮去。聽琴潛入王宮告訴丁瑤，如果她不想嫁榮狄，自己可以放她離開，丁瑤求之不得，在聽琴的幫助下，她逃出王宮，前往南越古洞。榮狄得知丁瑤逃跑，立即派衛遼去追，衛遼想追上丁瑤就殺了她，斷去榮狄的念想。丁瑤半路遇到妖怪，情急之下打碎了鎮妖瓶。
女媧傳說之靈珠第4集
問天跑到仙樂的陵前，望著靜靜沈睡的仙樂潸然淚下。魔音說如今靈珠散落四方，壹旦被妖魔尋到，重鑄鎮妖瓶，那後果不堪設想。丁瑤自告奮勇去尋找靈珠，榮狄堅決不同意，此時問天回到宮殿表示願意陪同丁瑤尋回十二靈珠。魔音將二人帶到神殿，告訴他們：昆侖山腳下有個村落，村裏的人世代守護大神女媧的陵墓，那裏有鎮妖瓶的秘密，建議他們首站去那裏。
女媧傳說之靈珠第5集
慕蓮醒來見自己全身纏著繃帶，她羞憤難當，巫女有個規矩，若被男子看到身體，不是殺了對方就是嫁給對方。無道說他救慕蓮，只是因為她是巫女，並無其他。慕蓮心中認定無道就是自己未來的丈夫。問天給丁瑤講起他與仙樂的經歷。龍族殿下無道突然出現，問天與無道展開大戰，兄弟相搏，問天不敵受傷，丁瑤用仙樂的仙笛幫忙終於保住問天性命，但陵墓鑰匙被搶走。
女媧傳說之靈珠第6集
慕蓮壹路前往南越都城，想尋求女媧右護法騰蛇魔音的幫助，殺時幽冥復仇。路遇逃婚的蜀國公主雨蝶。雨蝶刻意隱瞞身份，慕蓮不想與她同行。雨蝶壹路惹得不少麻煩，都被及時趕到的慕蓮化解。厚遇白水河妖，慕蓮出手與河妖打鬥，終於在雨蝶的幫助下殺死河妖，才發現原來這個河妖這麽厲害，是因為他手裏有壹顆靈珠。問天與丁瑤壹路追到龍族墓穴，兄弟二人又是壹場惡戰，無道要拿三叉戟，危急中三叉戟卻選擇了問天.
女媧傳說之靈珠第7集
丁瑤攙扶受傷的問天逃出龍族墓穴，找了壹處人家養傷。問天夢到父親，父親說這把戟留給問天，希望他用這件兵器好好保護自己和周邊的人。有人闖進仙樂的陵寢，盜走仙樂的屍體。衛遼帶兵追剿，發現盜墓的不是凡人。榮狄暴跳如雷，下旨要將守墓士兵全部處死，衛遼苦勸，榮狄不聽，反將衛遼重則五十金棍。
女媧傳說之靈珠第8集
問天說他有人族血統，所以月圓之夜會失去法力變成人，這個時候是他最脆弱的時候。半夜，寺院突然出現妖精，原來這寺院早就被妖精竊占，殺了全寺的僧人，變化人形專門吃過路借宿的人。丁瑤保護著問天慌不擇路，妖精卻在後面緊追不舍。危急中，慕蓮趕到，殺死妖精救下問天和丁瑤。慕蓮給丁瑤講述了女媧神卷裏記載的有關鎮妖瓶的壹切。
女媧傳說之靈珠第9集
巫山鬼母將仙樂屍體擺在祭臺上，做法為她招魂，卻發現根本無效，原來白矖魂魄早已再次轉世。魔音猜透了鬼母目的，誓要阻止丁瑤再回南越，卻遲人壹步，丁瑤被鬼母劫走。榮狄帶親隨追出都城救丁瑤，衛遼趁機盜出兵符準備奪權。無道身體漸漸復原，雨蝶路遇馬賊中刀受傷，被無道救活。魔音壹路催馬直奔巫山，試圖亡羊補牢阻止仙樂復活。
女媧傳說之靈珠第10集
衛遼將鎮守四方的幾位將軍請來，提出要取榮狄而代之，幾位將軍不肯背叛榮狄，隨即中毒而死。胡姬突然趕來，衛遼答應與胡姬合作。鬼母已經逼出丁瑤三魂七魄，眼見魂魄漸漸要被仙樂吸收。問天二人聯手對抗鬼母不敵，危急中魔音趕到，但白矖仙樂已經復活。復活後的仙樂並未聽從鬼母控制，出手將鬼母殺死。仙樂稱問天騙子，要殺死問天，情急之下丁瑤發出壹聲吶喊，將魂魄招回後也蘇醒了。
女媧傳說之靈珠第11集
無道取了龍牙劍，準備去南越都城找問天報仇。魔音回到王宮，叛軍紛紛倒戈，衛遼大驚，立即招來胡姬助陣。眼看魔音不敵，問天隨後殺到，問天打落胡姬身上的靈珠，胡姬帶傷逃走。衛遼戰敗，被逐出南越。魔音攝政南越，她要聽琴速去尋回榮狄，告訴他自己已經為他平滅叛亂，助他重登王位。衛遼逃到荒郊，遇到胡姬，胡姬勸其淪入魔道，奪回壹切。
女媧傳說之靈珠第12集
問天三人獲準來到南越古洞，丁瑤試著利用九星輪占蔔，發現了當年的真相。衛遼由胡姬引著前往幽冥宮拜見時幽冥。時幽冥賜給他妖力，並讓他成為魔族的大將軍。問天誓殺時幽冥，為仙樂報仇，給自己雪恥。丁瑤決定無論如何自己有責任尋回靈珠，但為了不讓父親著急，她要回去告訴父親壹聲。丁瑤回到現在，丁博士大喜，感慨的同時，同意丁瑤再次穿越回去。
女媧傳說之靈珠第13集
慕蓮看出了問天對瑤瑤的思念之心，但問天卻不願意承認。淪入魔道的衛遼帶領妖孽屠殺自己的同胞，問天和聽琴在危難之際被無道相救。為了榮狄，大祭司想殺死仙樂，但被榮狄射了壹箭，大祭司傷心欲絕。
女媧傳說之靈珠第14集
紫竹林前，問天決鬥無道，眼看抵擋不住，丁瑤便開始吹無憂曲為問天幫忙，雨蝶便馬上問九鬼無道是怎麽了。九鬼告訴雨蝶，雖然這個丁瑤有心想阻止兩人的決鬥，但是她的無憂曲會擾亂無道。無道將會有危險。雨蝶怕無道會有危險，也趕忙用樹葉吹曲，希望可以幫到無道。哪知丁瑤壹著急便對雨蝶發出了攻擊。這使無道十分氣憤，就出手傷了丁瑤。
女媧傳說之靈珠第15集
衛遼得知榮狄放棄王位，壹直追隨在仙樂左右，南越國是魔音攝政，他認為機會來了，如果殺了榮狄，自己自然而然就可以做南越王！衛遼找到榮狄，看到昔日的榮狄王現在就像個卑微的山野獵戶，他簡直不能理解榮狄所做的壹切！問天趕到藥王谷，卻發現自己到晚壹步，藥王已被胡姬所殺，仙藥盡毀！胡姬逃走，丁瑤危在旦夕，問天幾乎絕望…危機關頭，仙樂突然與榮狄來到藥王谷。
女媧傳說之靈珠第16集
問天告訴榮狄，魔音因為他而性情大變，南越現在壹片混亂，蜀國趁機攻打南越，榮狄說自己無心為王，他親筆寫了封信給魔音，希望她能原諒自己，南越王位自己拱手相讓。魔音將丁瑤藏身處泄露給時幽冥，時幽冥立即派胡姬前來追殺丁瑤，搶奪靈珠。慕蓮眼見仙樂、魔音都陷入愛恨糾葛苦不堪言，回想自己，心裏更加難過……自己的結拜妹妹如今和自己愛的人在壹起，她又該何去和從？
女媧傳說之靈珠第17集
丁瑤因為仙樂和問天大吵壹架，丁瑤不辭而別，準備回現代，但由於她的護身符被仙樂拿走，她根本回不去，但大話說出，又不好意思再回南越，於是她哀求聽琴，讓自己暫時躲在南越古墓。 女媧傳說之靈珠第18集
丁瑤離去，問天亂了陣腳，他四處打探丁瑤下落，魔音告訴問天丁瑤的下落。聽琴答應丁瑤幫她瞞住問天，於是她告訴問天丁瑤回屬於自己的時代了，問天黯然神傷。
女媧傳說之靈珠第19集
無道出手制住榮狄，仙樂趕來救下榮狄！無道驚訝女媧後裔怎麽能做出這麽殘忍的事？仙樂說女媧後裔也要活著，為了活著，不得不這麽做！無道搖頭嘆息不止，認為她本可以高高在上，世代受萬民敬仰，如果沒有妄動人間情感，愛上問天，也不會有今天的下場。
女媧傳說之靈珠第20集
魔音將南越政權歸還榮狄，榮狄再度登上王位，物是人非，恍然隔世。無道和問天終於殺死蛟龍，無道為保護問天受了傷。無道還替丁瑤尋來化解毒蠶絲的解藥，問天心存感激，無道卻根本不給他答謝的機會。
女媧傳說之靈珠第21集
榮狄為了紀念仙樂，他懇請丁瑤穿上仙樂的衣服，然後畫張畫像給自己留念。丁瑤說何必這麽麻煩？她有壹次性相機，於是丁瑤拍了自己穿古裝的照片，給榮狄留做紀念。 榮狄每日裏對著照片魂不守舍，魔音氣憤萬分。
女媧傳說之靈珠第22集
無道在幽冥宮對陣時幽冥，卻萬沒料到，時幽冥法力如此高強，眼見無道被時幽冥的妖氣籠罩，雨蝶不顧壹切撲到無道身上。眾人會戰時幽冥，卻發現根本傷不了他。時幽冥準備親自出手將眾人壹次性解決，這時仙樂趕到，她以仙笛化去時幽冥的不壞金身，問天以三叉戟對付時幽冥，時幽冥化作壹陣妖風逃去。
女媧傳說之靈珠第23集
雨蝶和無道同時被時幽冥妖氣籠罩，無道有法力護體沒有受傷，雨蝶卻被妖氣傷的奄奄壹息。無道帶著雨蝶趕到南越，請求仙樂救治雨蝶，仙樂提出壹個條件：要問天來求自己。
女媧傳說之靈珠第24集
無道只能去找問天幫忙，問天欣然答應去向仙樂開口，並沒有任何條件。問天說，雖然妳總是和我為敵，但妳畢竟是我哥哥，無道心中十分驚詫。仙樂救治雨蝶，發現她已經毒入骨髓，仙樂說雨蝶中毒太深，自己已經無能為力，惟有神農手卷上才有記載解毒的辦法，仙樂封住雨蝶經脈，無道和慕蓮立即趕奔蜀山神農廟，丁瑤在南越都城十分尷尬，於是她提出同去！
女媧傳說之靈珠第25集
時幽冥半路截住衛遼，衛遼連說這都是胡姬讓他幹的，請時幽冥饒他壹命！時幽冥把衛遼的心收在自己手裏，讓他回去監視胡姬，如果他敢在反叛，自己就抓碎他的心，取他性命！
女媧傳說之靈珠第26集
榮狄化裝潛入大牢，要救出仙樂然後遠走高飛！仙樂說自己不能走，自己走了，南越國就會亂，榮狄的祖先不會寬恕他們！仙樂說這牢房根本困不住自己，自己希望榮狄能下令處死自己，這樣就能保住榮狄在百姓心中的地位！
女媧傳說之靈珠第27集
魔音為了徹底置仙樂於死地，準備以九弦琴斷去仙樂的仙根，仙樂忍無可忍叫魔音不要苦苦想逼！魔音卻非要置她於死地，仙樂不得已才出手震斷九弦琴，將魔音打成重傷。
女媧傳說之靈珠第28集
時幽冥回到幽冥宮，此時胡姬已自封魔族女王，她令群魔動手鏟除時幽冥，結果衛遼出手制伏胡姬，胡姬求時幽冥饒她壹命，時幽冥說自己可以不殺她，但她的心也必須交給自己！
女媧傳說之靈珠第29集
丁瑤很著急，到處尋找問天的下落。問天的妖氣快要化盡，十分難受，他讓丁瑤別管她，自己快走。榮狄王也找到了丁瑤他們，問天急著要去救仙樂。魔音瘋了，還揚言要殺鬼帝等人，鬼帝利用高超功力將她打昏。無道誓要為雨蝶報仇，走到山神門卻被守山神將擋了去路，二人大戰起來，慕蓮在壹旁很著急。盒子裏突然有人說話，原來是鳳凰公主，她告訴林神她被時幽冥附了軀體，其他人都被她騙了。還說魔音也欺騙了大家，和魔族聯手了。
女媧傳說之靈珠第30集
仙樂告訴無道等人鳳凰宮裏沒人，時幽冥等人已經下山，還讓公主他們趕快下山幫問天攔截魔音和時幽冥。說完話，仙樂的身體就不行了。魔音質問時幽冥是否喜歡仙樂，他並沒有否認，還回想起以前的往事，後來他才意識到是魔音利用攝魂琴音來探究他的內心，他十分生氣。仙樂來找時幽冥，但時幽冥和魔音還是冥頑不化。公主看出了慕蓮喜歡無道的心思，慕蓮很不好意思。風神受了挑唆，和問天他們打得不可開交。
女媧傳說之靈珠第31集
衛遼與胡姬見形勢發展對鬼帝有利，從後面偷襲劫持丁瑤。時幽冥要挾問天交出六顆靈珠，聽琴說靈珠給他，三界就完了；慕蓮也勸問天大局為重。問天眼見丁瑤即將被胡姬吸幹血液，他只好交出剩余的靈珠。時幽冥但心問天和無道等人聯手，自己恐難取勝，於是他陰險地告訴無道，雨蝶是為了他才犧牲自己的，無道得知自己能救雨蝶，卻眼看著她死去的真相後，頓時心慌意亂，無力再戰。問天在眾人鄙視的目光中抱著丁瑤離開。
女媧傳說之靈珠第32集
魔音將榮狄救活，卻用自己的魔音控制住他。榮狄變成了魔音的傀儡，整天只知道圍著魔音轉，以魔音的意誌而轉移。九鬼代表無道前往幽冥宮，向時幽冥表達了和好的意思！時幽冥立即表示同意，並說自己絕對不會與龍族為敵！九鬼離去，胡姬問時幽冥，此時風頭正盛，為什麽不趁機消滅龍族，時幽冥說只要他煉出鎮妖瓶，三界都是他的，到時候小小龍族，不在話下。
女媧傳說之靈珠第33集
胡姬見問天恢復鬥誌，高興地告訴他，自己已經發現時幽冥的真正身份，他就是古年間被女媧降服的四大神獸之壹的朱雀神君。原來自龍族倒戈，朱雀獲封神籍後並不服輸，又再度反下天界，化身時幽冥，自封幽冥鬼帝，繼續為禍人間。胡姬說，她偷看的女媧神卷有記載：若想殺死朱雀，必須要有龍血、獸角和麒麟眼。獸角就是白澤（獨角獸）的角，只有問天與無道聯手才能獲勝！
女媧傳說之靈珠第34集
問天和丁瑤趕到蜀山，匯合了慕蓮，三人苦勸無道出山。問天說如今魔族大軍集結，看來很快就會向人間發動戰爭，他希望無道出手幫忙……無道說自己對人類本就沒什麽好感！若想自己出手，除非雨蝶能夠復活……問天氣無道如此意氣用事，壹怒下憤然離去！
女媧傳說之靈珠第35集
無道接到報告，說時幽冥已經在集結兵馬準備攻打南越城，無道決定去和問天他們會合。丁瑤整日守著九星輪不吃不喝，丁勉十分心疼女兒。丁勉為了女兒，認真修理九星輪，丁瑤卻說不管多危險都壹定要去，最終她又成功穿越過去。時幽冥大軍集結完畢，準備發動侵略人間的第壹戰，時幽冥令衛遼為大將軍，胡姬為先鋒，準備兵發南越國。魔音見到丁瑤，說她是妖女，要將她抓起來。
女媧傳說之靈珠第36集
魔族大軍洶湧殺來，榮狄號召全國人民團結起來對抗魔族大軍，戰鬥異常慘烈。時幽冥快要大功告成時，問天與無道趕到，準備與他大戰壹番。問天再看到丁瑤，十分開心。時幽冥拿著鎮妖瓶威脅眾人，問天他們讓丁瑤先走。危急時刻，仙樂附體，勸說時幽冥，但他根本聽不進去，壹番惡戰之後，終於將時幽冥消滅。問天和丁瑤也緊緊地擁抱在壹起。