萬州烤魚有著非常悠久的歷史。經過上千年傳承，再加上不斷改進創新，不斷調整配料，運用先腌後烤再燉的獨特技法，取傳統川菜和重慶火鍋的用料之精華，再結合獨特配方，調制出麻辣、醬香、泡椒、椒香、尖椒、蠔油、香辣、豆豉等幾十個不同口味，邊吃邊以小火持續煨。這種獨特的烹飪技術自成體系，風靡全國，逐漸成為萬州餐飲界的“金字招牌”。
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2008年，“萬州烤魚”被列為區級非物質文化遺產名錄項目。現如今，“萬州烤魚”被列為市級非物質文化遺產。
2018年4月，在第二屆重慶廚師節上，中國烹飪協會常務副會長喬傑向萬州區授予了“中國烤魚之鄉”牌匾，並頒發證書。
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萬州烤魚學院籌建於2018年，2021年經萬州區委批準成為重慶萬州技師學院增設內設機構，是萬州具備資質的烤魚專項職業能力認定機構。2021年，萬州烤魚學院被重慶市人力社保局評為重慶市職業技能品牌培訓機構，萬州烤魚被評為重慶市第壹批重點培育打造的勞務品牌和培訓品牌。