鰻苗經長途運輸，處於疲勞狀態，加上運苗容器內溫度與池水溫度差距過大（特別是加溫培育池），故需有壹個適應過程，具體做法是：將鰻苗箱置於池邊，逐漸用池水淋鰻苗箱，待鰻苗體溫接近池水水溫（壹般不相差5℃）時才將其放入事先置於池中的網箱內；如果用尼龍袋充氧運輸，可先將尼龍袋連苗放入池中，待袋溫接近池水溫度時再拆袋將鰻苗放入網箱內。鰻苗壹般暫養30分鐘～1小時（開增氧機），待活動正常後撇除死苗、汙物，分別過秤、計數放入各個鰻苗培育池內。
鰻苗體質嬌嫩，在采捕、暫養和運輸中容易擦傷而感染水黴菌和細菌性疾病。因此，在放養時必須進行消毒。消毒方法為藥浴，壹種是用容器進行藥浴，壹種是全池潑灑藥浴。
消毒步驟與方法：用容器藥浴時，壹般在大水缸中進行，故又稱缸浴。具體做法是，先在缸內盛清水300～400kg，然後按藥物用量比例，先溶化在少量水中再倒入缸內，並開啟曝氣機進行曝氣，不斷攪動水，使藥液均勻分布，然後稱取5kg左右鰻苗連篰壹起浸入藥液中藥浴10～15分鐘後，即可取出鰻苗放養。全池潑灑藥浴在傍晚進行，把藥物溶解後直接潑灑在壹級池中，開增氧機攪水，使藥液均勻分布。