日本交通方式主要有以下六種：
鐵路（國鐵和私鐵）
日本的鐵路系統包括JR以及地方私營鐵路（私鐵），加起來有上百條之多。如果是跨地區的長途路程，用JR鐵路居多；若在單壹或鄰近的區域活動，則選擇私鐵更多。
高峰時段為工作日的早上7點～9點、下午5點～7點。2.新幹線
新幹線為日本大區域之間移動的主力交通工具，類似我國高鐵。自1964年通車，目前壹***有7條主要線、2條迷妳線，主要線以時速260~320公裏/小時運行，迷妳線則以130公裏/小時運行。
3.地下鉄(ちかてつ）
大都會區的重要交通手段絕對少不了地下鐵。在東京裏面，就有TOKYO METRO（東京地鐵公司）運營的9條路線（丸之內線、東西線、南北線、有樂町線、千代田線、半藏門線、日比谷線、銀座線、副都心線）、以及都營線（東京都運行的路線）的4條路線（三田線、新宿線、淺草線、大江戶線），與私鐵交錯行駛。此外，大阪、神戶、名古屋、橫濱、京都、劄幌、仙臺、福岡也都有地下鐵。
4.高速巴士
高速巴士是主要在高速公路上行駛的公***汽車，也被稱為Highway Bus、長途巴士、夜行巴士（在夜間行駛時）。高速巴士具有連接各城市之間以及連接城市與旅遊景區之間等的多數路線，其特長是與飛機、鐵路相比，運費較低廉。
5.出租車
日本乘坐出租車不便宜，所以盡量選擇乘坐公***交通出行。
依照車輛的大小，分為大型、中型、小型，乘載人數各不相同。起跳價格（兩公裏以內的基本費）各地不同，晚間11點至次日淩晨5點采用夜間加成制，車費增收30%。在行駛高速公路時，也會加收費用。
6.自駕車
如果要在日本開車，請在來日本之前就先在自己的國家取得國際駕照，或是將自己國家的駕照更換為日本的駕照。