蠑螈和娃娃魚的主要區別是，科目分類不同、形態特征不同、生活習性不同，具體如下：
壹、科目分類不同
1、蠑螈
蠑螈，別名四腳魚，屬有尾目、蠑螈科、蠑螈屬。
2、娃娃魚
娃娃魚壹般指大鯢，屬有尾目、隱鰓鯢科、大鯢屬。
二、形態特征不同
1、蠑螈
蠑螈身體豐滿，呈圓筒形，與爬行類的蜥蜴很像，拖著壹條長而側扁的尾巴。皮膚潮濕潤澤，且有黏性，身體顏色異常鮮明—或長著明顯的斑紋，或有雞冠樣的突起。蠑螈的四肢較短，腳上無蹼。成體有眼瞼而且能動，但幼體沒有眼瞼 。
2、娃娃魚
娃娃魚體大而扁平，頭大扁平而寬闊，頭長略大於頭寬，體側有寬厚的縱行膚褶和若幹圓形疣粒，四肢粗短，後肢略長，指、趾扁平；前後肢貼體相對時，指、趾端間距相隔6個肋溝左右。
體表光滑濕潤，頭部背腹面小疣粒成對排列；眼眶周圍的疣粒排列較為整齊，更為集中，體側粗厚的縱行膚褶明顯，上、下方之疣粒較大；其他部位的皮膚較光滑。生活時體色變異較大，壹般以棕褐色為主，其變異顏色有暗黑、紅棕、褐色、淺褐、黃土、灰褐和淺棕等色。
三、生活習性不同
1、蠑螈
蠑螈屬動物生活在丘陵沼澤地水坑，池塘或稻田及其附近。10月到次年3月多在水域附近的土隙或石下進入冬眠。3～9月多在山邊水草豐盛的水坑或稻田內活動。底棲，爬行緩慢，很少遊泳。多在水底覓食蚯蚓、軟體動物、昆蟲幼蟲等。
2、娃娃魚
成鯢壹般常棲息在海拔1000米以下的溪河深潭內的巖洞、石穴之中，以灘口上下的洞穴內較為常見，白天常臥於洞穴內，很少外出活動，夏秋季節，也有白天上岸覓食或曬太陽的習性。大鯢壹般夜出晨歸，常住壹個洞穴。捕食主要在夜間進行，常守候在灘口亂石間，發現可獵動物經過，突然張嘴捕食。大鯢適宜棲息於水溫3～23℃的水中。
中國大鯢在不同的水域中，食物來源也略有不同，它們食量大，主要捕食水中的魚類、甲殼類、兩棲類及小型節肢動物等，此外在大鯢的胃中也發現有少量植物組分。生活在長江流域大鯢所處棲息地內，有著白甲魚、寬口光唇魚、馬口魚等魚類，為大鯢提供了廣泛的捕食對象。
以上內容參考?百度百科-蠑螈、百度百科-娃娃魚