實驗室檢查主要包括生物學檢查和理化檢查。生物學檢查又包括微生物學和寄生蟲學，它們分別確定傳染病的病原和寄生蟲病的病原；理化檢查是確定由中毒或者代謝原因導致的疾病理化因素。以下簡單介紹有關的主要實驗室檢查內容。
（1）微生物學檢查。
病料塗片鏡檢：對於壹些具有特征性形態的病原體，比如曲黴菌、巴氏桿菌、葡萄球菌等，通過取有顯著病變的特定組織器官作的塗片和染色鏡檢作出初步診斷。
用病料直接制作觸片或塗片鏡檢的方法較簡單，但因為細菌太少，常難以觀察到。有條件時應將病料接種到培養基上進行培養，然後用培養物塗片鏡檢。這樣不僅能觀察到大量細菌，還可根據培養後細菌菌落大小、形態、顏色來鑒別細菌。
分離培養和鑒定：用人工培養的方法，如用雞胚、組織培養及人工培養基培養等，將病原體從病料中分離出來，並進壹步對所分離的病原體進行形態學、培養特性、生化特性檢查和動物接種以及血清學檢查等作出準確的鑒定。
動物接種實驗：將分離或可疑的病料接種於易感的實驗動物，如雛雞，小白鼠，豚鼠等，根據接種動物所出現的臨床癥狀和病理變化等特征來進行診斷。
血清學診斷：血清學診斷是利用抗原和抗體之間的特異性反應來進行疾病確診。該法具有高度的特異性和敏感性。可用已知抗原或抗體測未知的抗體或抗原，是傳染病的重要診斷方法。常用的血清學方法有凝集反應、瓊脂擴散反應、中和試驗和免疫熒光抗體技術等。
（2）寄生蟲學檢查。雞體內的寄生蟲，如球蟲、滴蟲、蛔蟲和絳蟲等大都寄生於消化道內，它們的蟲卵、卵囊、蟲體和幼蟲壹般都是通過糞便排出體外，所以采其糞便進行直接塗片，或離心沈澱浮卵、飽和鹽水浮卵和水洗沈澱等方法在顯微鏡下觀察。
（3）病理組織學檢查。壹些疾病的組織器官有特征性典型病變，比如馬立克氏病、白血病、包涵體肝炎等均可選取這些病變組織器官，通過常規病理組織學檢查進行確診。
（4）理化檢查。主要是毒理學檢查，雞的中毒性疾病可根據臨床癥狀、剖檢變化並結合病因的調查作出初步診斷，但確診需要根據家禽中毒的類型，如農藥、飼料和藥物等，選用不同的檢查方法進行實驗室檢驗。