微波加熱的原理是通過微波輻射引起食物中分子間的摩擦和振動產生熱量，就像兩只手摩擦產生熱量壹樣。分子之間的摩擦叫內耗，每秒產生3000次以上的振蕩，微波爐的熱量就來自這裏。
所以微波加熱只是物理加熱。這種加熱方式本身就是讓食物由內而外變熱，但不會引起食物發生化學變化，所以不會產生所謂的對人體有害的物質。
擴展數據:
微波爐使用中的註意事項:
1.微波爐應放置在均衡通風的地方，背面不小於10 cm，頂部不小於5 cm，以利於排氣散熱，並遠離有磁場的家用電器，以免影響烹飪效果。
2.微波爐不要放太多食物，最好不要超過1/3的容積。食物不應直接放在轉盤上，而應放在耐熱玻璃、陶瓷或耐熱塑料制成的容器中。切勿使用金屬或搪瓷容器，也不要使用帶有金屬圖案的容器。
3.禁止用微波爐加熱密封的食物，如袋裝、瓶裝、罐裝食品，帶皮帶殼的食物，如栗子、雞蛋等，以免爆炸汙染或損壞微波爐。
4.嚴禁空載使用微波爐。平時可以在烤箱裏準備壹杯水，用的時候拿出來，加熱食物後再放進去，避免空載燒壞微波爐。
5、由於微波空氣穿透的功率有限，體積過大的食物要均勻分解，避免食物生熟不均。加熱整個雞，鴨和其他大型食品。加熱壹段時間後最好把食物翻過來，讓各部分受熱均勻。
6、微波爐在使用過程中，應有效保護爐門，防止因爐門變形或損壞而導致微波泄漏。當烤箱門打開時，試圖啟動微波爐是非常危險的。
7、選擇烹飪時間寧短勿長，以免食物過熱、燒焦甚至著火。並且反復加熱非常方便。
8.微波爐工作時，應遠離爐體。雖然有安全保險，但也要防止微波輻射對人體的傷害。
人民網-微波爐使用禁忌:這些食物不能進入微波爐。
人民網-食品安全專家:微波加熱食物不會致癌。