1，藥檢
原子光譜檢測毒品時，主要檢測的元素是砷、汞、硒等重金屬元素。使用的主要儀器是原子質譜。劉傑等利用HPLC-ESI/TOFMS簡單、快速、有效地鑒定出丹參中的16丹參酮。
曹軒等人用微波消解-電感耦合等離子體質譜法測定了滸苔中的銅、砷、鎘、汞和鉛。檢出限為0.28 ~ 2.3 μ g/L-1，回收率為83% ~ 108%。李文龍等人利用加速溶劑萃取-二極管陣列高效液相色譜(ASE-HPLC-DAD)-ESI-TOFMS分析鑒定了蓮子心中的六種生物堿。
2、食品和飲料檢測
采用LA-ICP-MS測定食品和飲料中的砷ⅲ和砷ⅴ、單甲基砷酸(MMA)和二甲基砷酸(DMA)。氫化物發生-原子熒光光譜法也被用來分析砷的形態。用陰離子交換高效液相色譜-電感耦合等離子體質譜法測定壹甲基硫代砷酸鹽(MMTA)、MMAⅲ和MMA ⅴ的含量，用流動註射-電感耦合等離子體質譜法或流動註射原子吸收光譜法測定總砷含量。
食品和飲料中的無機汞(iHg)、甲基汞(MeHg)、乙基汞(EtHg)以及Pbⅱ、三甲基鉛和三乙基鉛可以通過ICP-MS使用直接進樣和高效原子化器進行檢測，也可以通過ICP-AES進行預濃縮，如濁點萃取。還有帶在線電磁加熱柱的AFS分析iHg和MeHg在海鮮中；
通過直接註射ETAAS分析總汞；也有采用冷蒸汽原子吸收光譜法(CVAAS)或熱分解汞齊原子吸收光譜法(TDA-AAS)分析魚中總汞的報道。肉和全脂乳中硒蛋氨酸(SeMet)和硒半胱氨酸(SeCys)的檢測可以通過離子對HPLC-ICP-MS進行；
在線雙柱FI-ICP-MS也可用於分析se ⅳ和se ⅵ、有機se和SeCys，檢出限為45 ~ 210 ng.l-1。日本學者利用ESI-MS-MS分析了日本辣蘿蔔中的Seⅵ、SeMeCys和壹種新發現的硒成分——硒代高羊毛硫氨酸。
與紫外激光相比，采用紅外飛秒激光的LA-ICP-MS可以將硒蛋白分析的靈敏度提高40倍。還報道了Pd(NO3)2用作改進劑，用ETAAS分析食品中的總硒。