石花洞的洞身分為上下兩層。目前只有壹到四層對外開放，總長2500米。現在壹、二、三、四樓都對外開放。洞內自然景觀精致，多姿多彩，變化多端，滴水流水，地質奇觀層出不窮。四層洞壁被石封閉，五層堂高大，洞壁松軟，空氣清新，六層堂待探。
石花洞內的自然景觀精致多彩，種類繁多，有高大潔白的石筍、石竹、鐘乳石、石簾、石瀑、側槽、石壩、石梯田，還有許多由滲透水、濺水、毛細水沈積而成的石花、石枝、卷石、水晶花、石毛、石菊花、珍珠珍珠等。自然造型也有很多，比如烏龜持珠等等。有晶瑩剔透的鵝管、珍珠寶塔、燈光墻等。許多彩色的石旗和美麗的石盾是中國洞穴沈積物的典型，在中國洞穴中首次發現大量的月乳蓮。
石花洞現已形成20個景點，150多處主要景觀，遠遠望去相互呼應，相映成趣。“瑤池石蓮”距今已有32000多年的歷史；“龍宮豎琴”是中國第壹簾洞天。“銀旗卷簾”、“三柱洞天”等十二大洞天奇觀，無不令人嘆為觀止。“世界洞穴奇觀展”在石花洞入口處開幕，* * *展出數百張世界著名洞穴景觀照片；洞外還有“野生動物展”和“奇石展”。
石花洞溶洞資源以其獨特的典型性、多樣性、自然性、完整性和稀有性而享譽國內外。豐富的地質資源顯示了石花洞在地質科學研究、地質科學教學和旅遊觀賞方面的價值。石花洞洞穴沈積物記錄了地球的演化和沈積環境的變遷，是研究古地質環境變遷的重要信息庫。石花洞石筍見證了2650年夏季北京的氣候變遷。國際地質科學聯合會國際行星地球年項目負責人漢克·沙克在考察結束後評論道。“參觀中國第壹地質公園石花洞很有趣，是人們開展地學教育的好榜樣”。原國家科委主任宋健視察後高興地題詞“地下地質奇觀，洞穴博物館”。