由於化肥的持續使用，不僅造成環境汙染，而且導致土壤板結，肥效降低。化肥汙染已被列為農業汙染源之壹。微生物肥料的發展不僅為農業的發展提供了新的能源，而且減少了肥料的汙染。
微生物肥料是以人畜糞便為主要原料，以稭稈、樹葉和酒糟、鋸末等農副產品加工廢棄物為輔料，通過高溫發酵進行無害化處理的生態有機肥。以雕落物為例，具體方法如下:
準備材料:
先將雕落物粉碎，用1 ~ 1.5噸雕落物和2.5 ~ 3.5噸鮮料，1公斤金寶貝菌肥發酵劑配合使用。先將金寶貝菌肥發酵劑與米糠(或玉米粉、麥麩)以1: 5 ~ 10的比例混合備用。
調整C/N
發酵有機肥的C/N(碳/氨)應保持在25 ~ 30: 1，因為落葉和幹草的C/N太低，要調整。因此，1噸幹草葉應加1公斤尿素(或50公斤牲畜糞便)。
控制濕度
雕落物的含水量應控制在60% ~ 65%。水分判斷:緊緊握住壹把材料，看到手指間有水印，不滴水，落地時散開為宜。水分少導致發酵慢，水分多導致通風不暢，也會導致“腐敗菌”工作，產生異味。
造樁要求
準備好的材料應在傳播細菌時堆放。堆高和堆量不能過小或過小。要求:樁高1.5m，寬2m，長2-4m或更長。
溫度要求
最佳起始溫度在15℃以上(四季均可操作，不受季節影響，冬季盡量在室內或溫室內發酵)，發酵溫度控制在70-75℃之間。
翻轉供氧
肥料發酵劑要求好氧發酵，所以在操作過程中要增加供氧措施，以攪拌均勻、勤翻、通風為宜。否則會導致厭氧發酵，產生異味，影響效果。
發酵完成
壹般物料堆放48小時後，溫度升至50℃ ~ 60℃，第三天可達65℃以上。這麽高的溫度，應該翻壹次。壹般發酵過程中會有兩次65℃以上的高溫，壹周內即可完成發酵。物料呈深褐色，溫度開始降至常溫，表明發酵完成。
雕落物經肥料發酵劑發酵後，能徹底除臭、分解、殺蟲、殺菌。發酵有機肥富含多種作物所需的微量元素。具有無毒、增產、改善品質、抗病、促生長、培肥地力、提高化肥利用率的功能。是生產綠色食品、發展生態農業的理想肥料，真是壹舉兩得。