紫水晶可以呈現紫色，因為它與鐵和錳等礦物質混合在壹起。這種顏色比較特別，所以被認為是可以提升靈性和智慧的佳品。具有寶石價值的紫水晶產於頁巖、偉晶巖或火山巖等洞穴中。
“雖然紫水晶的雙折射和堇青石相似(0.008到0.012)，但顏色和多色的區別是很明顯的。青金石的顏色是紫藍色，紫水晶的紫色很少出現。皮革青石明顯多色，肉眼可見，從不同方向可以看到不同的顏色。紫水晶是同壹種顏色，深淺不同(藍色和紫色到紫色的深淺不同)。另外，紫水晶是單軸晶體，有靶心幹涉圖樣，而董青石是雙軸晶體。”——引自百度百科。
紫水晶的顏色還是和別人不壹樣的。紫水晶的鑒定可以用手摸。壹般水晶石內溫度較涼，會有天然冰裂縫或白雲雜質。特別是天然水晶，有著現代產品無法模仿的塊狀內含物。
還可以觀察它的二色性，從不同角度觀看刻面。即使是頂級的紫水晶也有色差。把紫水晶舉起來對著太陽看，可以看到裏面有淡淡的橫紋或者柳絮狀的物體。即使用放大鏡，也不可能發現氣泡。