龍眼和荔枝的區別在於種屬、花朵葉片、外形、果殼、果實、口味。
1、種屬
雖然科屬相同，但兩者的種屬不同，科荔枝屬的常綠喬木所結出的果實，龍眼是常綠大喬木所結出的果實。
2、花朵葉片
荔枝樹為聚傘花序，花朵的顏色的黃綠色的，而龍眼樹是圓錐花序但簇生，花瓣的顏色呈現出黃白色或近似黃白色；荔枝葉片壹般是奇數羽狀復葉，橢圓披針形，邊緣有刺，而龍眼是偶數羽狀復葉，呈長圓披針形。
3、外形
基本上所有的龍眼的外形是很圓的，幾乎呈球形；而荔枝的外形則是草莓形狀，並不圓滑，個頭要比龍眼大很多。
4、果殼
這是最明顯的不同之處，龍眼外殼顏色為棕褐色、灰褐色，而且果殼比較光滑；而且荔枝外殼鮮紅，外殼還有凹凸紋理，像鱗斑狀的凸起，形成鮮明的對比。
5、果實
龍眼果肉薄，易剝離，果肉微微泛黃；而荔枝果肉相對厚且難剝，果肉呈白色。
6、口味
其實仔細品味，兩者的口味差別還是比較大的，龍眼口感清香甘甜，有藥味；荔枝果肉口感甜，但有時會酸澀。