菠蘿黑心病可發生在采摘前或采摘後，貯藏、運輸或銷售過程中。秋冬季采收的菠蘿可達10%-20%，有時夏季采收的菠蘿也可發生。國外很多研究者認為其病因主要是低溫引起的。據報道，菠蘿在低於25-22℃的低溫下會發生冷害障礙。後來有學者認為，菠蘿對黑心病的敏感性始於田間，收獲後的環境只是強化了這種敏感性。田間低溫可能引起代謝的壹些變化，產生導致“黑心”的前體物質，然後低溫(4-8℃)儲存運輸，促進前體物質的積累。如果放在20℃的高溫下7天，前驅物會變成毒藥，導致“黑心”。但如果繼續低溫保存，前體就會停止合成，變成無毒化合物。這種毒藥可能是壹種棕色酚鹽化合物。我國學者認為，誘發菠蘿黑心病的因素除了低溫外，還有赤黴素(GA3)。廣州夏季采收的菠蘿通常不受低溫影響，壹般在采收後1個月內不會發生黑心病，但如果采收後用GA3處理，也會發生黑心病。我國有學者對縱切後的無病菠蘿果實進行了研究，結果表明，菠蘿通常易受冷害的溫度為5-10℃。在實驗條件下可發生黑心病，無凍傷的對照組也有個別黑心病。這說明冷害和菠蘿黑心病之間沒有因果關系。縱切後的果實明顯破壞了果實采收後整個果實的自然成熟過程及其代謝的正常變化。上世紀六七十年代，有學者提出黑心病是壹種病因不明的生理性疾病。