洋蔥通常在相對潮濕的環境中發芽。在這種情況下，不會像土豆發芽壹樣產生茄堿等有害物質，所以食用發芽的洋蔥不會造成身體傷害。只是洋蔥發芽後，營養成分的含量、比例、味道都發生了變化。
但在潮濕的環境下，洋蔥在發芽的同時容易發黴，需要仔細觀察，排除這種情況。如果吃了長了芽、發黴的洋蔥，很容易導致中毒，尤其是很多黴菌，比如黃曲黴，能分泌黃曲黴毒素，是壹種致病性很強的物質。
洋蔥是百合科和蔥屬多年生草本植物。鱗莖厚，近球形；紙質至薄革質，內皮肥厚，葉多肉，圓柱形，中空，中部以下最厚，向上較窄，比花葶短，花葶粗壯。
傘形花序呈球形，有許多密集的花；花粉白色；花被片有綠色中脈，長圓狀卵圓形，等長的花絲，近球形子房，腹部縫合基部有帶簾的凹蜜穴；5-7月開花結果。紫皮洋蔥富含花青素，蛋白質、膳食纖維、鈣、鎂、鋅、鐵等礦物質含量高於黃皮和白皮洋蔥，但後兩者的胡蘿蔔素和維生素C含量高於紫皮洋蔥。
從口感上來說，白洋蔥味甜，肉質細嫩，水分高，適合鮮食、烘焙或燉煮。黃皮洋蔥味微甜微辣，適合生吃或蘸醬食用；紫洋蔥味道最辣。