病毒性上呼吸道感染和細菌性上呼吸道感染的癥狀差別不大。兩者都會出現流鼻涕，打噴嚏，喉嚨癢，幹燥，甚至喉嚨痛。由於微生物病原體的不同，兩者的癥狀略有不同。
上呼吸道感染的常見病原體70%-80%是病毒，主要包括副流感病毒、腺病毒和麻疹病毒。上呼吸道癥狀明顯，尤其是鼻部癥狀，鼻塞、流鼻涕明顯，壹般無分泌物。您還可以看到全身癥狀，如發燒、肌肉疼痛、惡心和嘔吐。
細菌感染約占20%-30%，以溶血性鏈球菌最常見，其次是流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和葡萄球菌。通常扁桃體炎或咽喉炎癥狀明顯，如咽痛，細菌感染會有大量痰甚至膿痰，壹般沒有發熱和肌肉疼痛。
病毒感染也可以合並細菌感染，往往很難區分。血常規病毒感染多為淋巴細胞增多，應在醫生指導下使用阿昔洛韋、利巴韋林等抗病毒治療，細菌多為中度增多，可使用莫西沙星、氧氟沙星等口服抗菌治療。上呼吸道感染需要多喝水，註意休息，增強抵抗力。如果惡化，需要去醫院治療。