第壹次，當1 ~ 2片垂直葉出現時，每667平方米施入1 000 ~ 1 500公斤人糞或糞肥或1 500公斤尿素，以促進垂直葉的生長。
第二次是在荷葉合攏前，每667平方米施50公斤復合肥；第三次是蓮藕前，每667平方米施復合肥20公斤，硫酸鉀15公斤。
如果打算在7月中下旬采摘嫩藕，或者藕田肥力較高，植株生長旺盛。第三次追肥可以省略。追肥時要選擇晴朗無風的天氣，避免在烈日炎炎的中午。施肥前要放出部分田間水，保持淺水層。肥料滲入土壤後，要註入到原來的水位。如果葉子沾上化肥，應立即用水沖洗，以防燙傷。
生石灰也是蓮藕的肥料。施用後不僅能降低節水土壤的pH值，使過於柔軟的漚制泥更加堅實，有利於蓮藕的生長，還能防止蓮藕蛆、腐爛、水綿的發生。
施用生石灰的適宜時間是蓮藕長出兩片豎葉時，因為此時幼莖和新葉剛生長，最易受藕蛆的危害。生石灰也可在蓮藕種植前全田施用，施用生石灰的時間應與施用氮肥或過磷酸鈣的時間相隔15天左右。間隔過短，肥效會降低。
施生石灰時，先把田水淺壹點，然後把生石灰塊撒到荷葉少的空處。待其溶解後，用鏟子攤平，與土壤混合。每667平方米使用50公斤生石灰。