1、地理分布不同
木耳：中國是木耳的主要生產國，產區主要分布在吉林、黑龍江、遼寧、內蒙古、廣西、雲南、貴州、四川、湖北、陜西和浙江等地，其中黑龍江省牡丹江地區海林市、東寧縣（2012年12月晉升為國家級木耳批發市場）和吉林省蛟河縣黃松甸鎮是中國最大的黑木耳基地。
木耳菜：產四川（木裏）、雲南（鳳儀、漾濞、順寧、貢山、福貢、怒江、楚雄、景東、安寧、臨滄）、西藏（吉隆、通麥、察隅）。生於林下、山坡或路邊草叢中，海拔1350-3400米，印度、尼泊爾、緬甸、泰國也有分布。
2、生長習性不同
木耳：寄生於陰濕、腐朽的樹幹上，生長於櫟、楊、榕、槐等120多種闊葉樹的腐木上，單生或群生。人工培植以椴木的和袋料的為主，人工培植以椴木和袋為基體，潮濕地帶生長比較多。
木耳菜：生於林下、山坡或路邊草叢中，海拔1350-3400米。
3、營養價值不同
木耳：黑木耳含蛋白質、脂肪、多糖和鈣、磷、鐵等元素以及胡蘿蔔素、維生素B1、維生素B2、煙酸等，還含磷脂、固醇等營養素。木耳營養豐富，被譽為“菌中之冠”。
木耳菜：木耳菜的營養素含量極其豐富，尤其鈣、鐵等元素含量最高，除蛋白質含量比莧菜稍少之外，其他項目與莧菜不相上下。
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