1、外觀形態的區別有：生蠔與牡蠣都屬於貝殼類軟體動物，但是生蠔的兩殼不等，其中下殼偏大而凹陷，觸摸起來比較粗糙，而牡蠣的外殼壹個小而平，另壹個大而凸，外殼的整體形狀呈三角形。
2、生活環境的區別：生蠔壹般喜歡生長冰冷的海水中，不同的生長環境對肉質的口感具有較大的影響，而牡蠣對海水的溫度、環境要求不高，基本世界上所有的沿海地區都有分布，數量種類也更多。
3、營養價值的區別：生蠔屬於牡蠣的壹個品種，但是在營養價值上比牡蠣高許多，例如鋅含量，每100克生蠔中含有71.2毫克的鋅，而每100克的牡蠣鋅含量只有9.39毫克，另外生蠔的蛋白質也含量也高於牡蠣。
4、個頭大小的區別：生蠔生長速度比較慢，繁殖能力較弱，所以數比較少，但是在個頭上壹個可以達到1斤重，養殖時間在2到3年，而牡蠣的數量多繁殖速度極快，通常情況下壹年時間即可出產，個頭偏小。它們既有相同點，也有很大的不同，生蠔、牡蠣，都是市場上常見的海鮮，很多人愛吃，營養價值高，味道鮮美。