食用幹品時，最好用清水或溫水多次浸泡後再食用，以去除殘留的有害物質，如二氧化硫等。食用鮮黃花菜中毒多發生在黃花菜成熟季節的6、7月份。秋水仙堿氧化物對胃腸粘膜和呼吸道粘膜有強烈的刺激作用，引起惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、口渴、腹脹等癥狀。嚴重者可出現便血、血尿或無尿。鮮黃花菜中的秋水仙堿易溶於水，食用時可根據其特性進行處理。
食用前數小時將新鮮黃花菜用冷水浸泡2小時以上，中間換水壹次為佳；或者用開水燙過壹次後用冷水浸泡2小時，以免引起中毒。每次吃不超過50克為好。因為每50克鮮黃花菜中含有約0.1毫克秋水仙堿，不會引起中毒。中毒患者主要根據癥狀進行治療，特別要註意補充水分，不能脫水，不能口服時要及時給予靜脈輸液。