海蛇喜歡棲息在大陸架和島嶼周圍的淺水中，在水深超過100米的遠海中很少見。它們中的壹些喜歡呆在沙子或泥漿底部的混合水中，而另壹些喜歡在珊瑚礁周圍的清澈水中活動。海蛇在不同的深度潛水，有些更深，有些更淺。已經在四五十米的深度看到過海蛇。淺海蛇壹般下潛不到30分鐘，在水面停留時間很短。它們只是壹次露出頭，深呼吸，然後再次潛入水中。深水海蛇在水上停留的時間很長，尤其是傍晚和夜間。它們可以潛水長達2-3個小時。海蛇成群，往往成千上萬只沿河漂流，方便垂釣。它也有趨光性，晚上用燈光誘捕更有收獲。海蛇有成群結隊的習性，往往成千上萬只聚集在壹起，順流而下。所以海蛇的生殖交配極其壯觀。每當繁殖季節來臨，雌、雄海蛇往往成群結隊，有時數量可多達百萬，相互追逐，隨波逐流。有時候隊伍可以綿延幾公裏。當他們聚集在港口時，連船只都無法正常航行。據悉，在馬六甲海峽，曾經有海蛇聚集在壹起，做了壹個寬壹米，長60海裏的之字形蛇陣，組織嚴密，氣勢磅礴。
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