男性尖銳濕疣的癥狀主要發生在包皮系帶、冠狀溝、包皮、尿道、陰莖、肛門、陰囊。發病初期為淡紅色或汙紅色小米大小的顆粒,質軟,頂端略尖,逐漸長大或增大。尖銳濕疣的癥狀可發展為乳頭狀或囊狀,基部略寬或帶狀,表面有顆粒。肛門內尖銳濕疣常腫大,似菜花,表面潮濕或出血,顆粒間常積膿,散發惡臭,搔抓後可導致繼發感染。尖銳濕疣,位於濕度較低的幹燥部位,往往損傷較小,呈扁平疣樣。位於濕熱部位的尖銳濕疣癥狀常呈絲狀或乳頭狀瘤樣,易融合成大塊。